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食管癌是世界上最常见的癌症之一，约有一半以上的病例发生在我国。本室用差异显示PCR（DD-PCR）法从正常食管上皮和食管癌及组织中分离了4条差异EST片段，分别命名为食管癌相关基因1～4（Esopageal Cancer Related Gene，ECRG-1～4）。本课题着重于ECRG-2、ECRG-4的克隆、鉴定以及编码蛋白生物学特性的初步探讨。 一．ECRG-2基因的研究 1．ECRG-2基因cDNA全长和基因组结构确定 以183bp的ECRG-2 EST序列为基础，利用SMART RACETM技术从正常的食管组织中克隆了该基因569bp的cDNA，长度与Northern blot实验检测结果基本一致。序列分析结果表明我们获得了ECRG-2的全长cDNA：（1）该基因含有258bp的完整读码框，编码85个氨基酸：（2）5’端cDNA翻译起始密码的上游有同框终止密码子（3）3’端有典型加尾信号AATAAA序列和poly A尾。该序列登陆Genbank（AF 268198），美国国立生物技术信息中心（National Center of Biotechnology Institute，NCBI）将与ECRG-2来源于同一基因的序列归为一个唯一序列族（Unigene Cluster）Hs.244569。RH方法和ECRG-2基因的染色体同源性比较同时表明ECRG-2基因定位于5q32-33。由此确定ECRG-2基因全长3540bp，由4个外显子和3个内含子组成，外显子和内含子之间的结构符合GT-AG法则，转录起始位点前-40bp区域为启动子，-22～-30bp为TATA box结构。 2．ECRG-2组织表达分析 RT-PCR、Northern杂交、网上表达系列分析（Virtual Northern）以及Unigene族Hs.244569资料显示ECRG-2具有广泛的表达谱：ECRG-2在成人食管，脑、甲状腺、口腔粘膜、胎儿皮肤、胸腺中高表达；在胎儿食管、脑、肺、支气管、小肠、胃、心脏、肌肉、大肠、脾、肾、胆囊组织中呈微弱表达；在食管癌旁、食管癌、大肠癌、脑顶叶原发瘤组织中的表达明显下调。以食管癌旁和癌组织中差别最为明显，阳性率分别为65％和21％。