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果桑遗传背景复杂,形态特征差异较大,传统形态学方法难以鉴别分类;而且对不同果桑品种的遗传多样性进行研究,有利于发现和利用与重要目标性状相关的基因位点上的有利变异。本研究利用SRAP和EST-SSR两种分子标记对供试15个果桑品种的遗传多样性进行分析,比较两种分子标记的分析效力,开展品种鉴定并构建DNA指纹图谱。从分子水平揭示果桑品种间的多态性,指导其种质资源的鉴定和利用,为快速选育优良果桑新品种提供理论基础。主要研究结果如下:1.采用改良的CTAB法提取果桑基因组DNA,其质量和产量均能满足试验需求。2.42对SRAP引物中筛选出17对扩增条带清晰、多态性高的引物组合,对15个果桑品种扩增共得到306个位点,其中多态性位点达253个,多态性比率为82.68%,扩增的DNA片段集中在100~1000bp之间,平均每个引物扩增条带为18条。3.26对EST-SSR引物中筛选出18对多态性引物用于15个果桑品种的扩增,共得到297个位点,多态性位点236个,多态性比率为79.46%,平均每个引物扩增的条带为16.5条,扩增得到的DNA片段集中在100~400bp之间。4.基于SRAP标记的15个果桑品种间的遗传相似系数在0.3909~0.8111之间,平均相似系数为0.6199,幅度范围为0.4202。基于EST-SSR标记的15份果桑种质材料间的遗传相似系数在0.3801~0.8581之间,平均相似系数为0.6487,幅度范围为0.4780。5.根据EST-SSR和SRAP扩增出的条带分别建立0/1矩阵,转换为二进制编码形成15个果桑品种的数字指纹图谱,简便快速区分每份材料。6.通过非加权组平均法聚类分析,绘制树状聚类图。EST-SSR和SRAP均将15个果桑品种分成三大类。EST-SSR和SRAP及两标记综合数据的遗传相似系数矩阵进行相关性分析,得出EST-SSR和SRAP均与综合数据呈显著相关。