论文部分内容阅读
系谱记录是明确个体间亲缘关系,以个体选择为主的现代育种实践,是动物遗传育种的重要信息来源。然而,随着社会经济的不断发展,人类对高产的盲目追求,加上大量高产外来品种的引进,导致大尾寒羊品种受到了前所未有的破坏,存栏量逐年下降。目前,在山东省内建立大尾寒羊国家级保种群已迫在眉睫。由于大尾寒羊个体来源复杂,原保种群管理不严格,存在分子系谱不清楚,遗传结构不清晰等问题,为保护大尾寒羊遗传资源,需通过分子手段了解大尾寒羊个体间的亲子关系,构建分子系谱,识别杂交个体,制定育种计划。本研究对大尾寒羊保种群145只个体为材料,选取25个微卫星位点,预实验采用40只个体进行混池检测,筛选了15个多态性较高的微卫星位点,用于亲权鉴定和分子系谱构建。Cervus3.0进行亲子关系分析,例如:杂合度(H)、多态性信息含量(PIC)、给定候选亲本与子代基因型,排除候选亲本的概率(NE-1P)、给定已知亲本基因型、候选亲本基因型和子代基因型,排除候选亲本的概率(NE-2P)和多个位点的累积排除概率(CEP),以及Hardy-Weinberg平衡检测。用Pedigraph3.0软件,绘制具有复杂近交系结构的家系系谱图,用SPSS软件进行相关性分析,分析每个微卫星位点给定候选亲本与子代基因型,排除候选亲本的概率(NE-1P)和给定已知亲本基因型、候选亲本基因型和子代基因型,排除候选亲本的概率(NE-2P)与PIC、He、Ho、K、N多态性参数的相关性。用Genepop、SPAGeDi、Arlequin、SPSS、MEGA软件对所构建的分子系谱进行遗传结构分析,结果如下:(1)在混池检测的40只大尾寒羊中,对25个位点进行多态性筛选,通过比较分析等位基因数,多态信息含量等因素,选取了15个等位基因数目较多、多态性较高的微卫星位点用于大尾寒羊分子系谱的构建及遗传结构分析。从25个微卫星位点中筛选出的15个微卫星位点,检测到293个等位基因,等位基因均在13个以上,平均等位基因为19.533,其中INRA063在大尾寒羊中的等位基因数最多达到30个,BM1225、MB023等位基因数较少,为13个。其所有位点PIC值在0.707-0.895范围内,均超过0.5,属于高度多态性位点。大尾寒羊群体的平均期望杂合度较高。(2)在双亲都未知时累计父权排除概率为0.99999028,置信度在80%以上,最终从145只样本中,16个子代找到父亲,11个子代找到母亲,结合SPAGeDi计算的亲缘系数,推断出亲缘关系远近,根据亲子关系及亲缘系数推断结果,划分为10个家系。用Pedigraph3.0构建10个家系分子系谱图以及群体分子系谱图。(3)在大尾寒羊群体中,POP8与其他家系遗传距离相对较高,均大于0.1;除了POP8和其他家系的遗传距离,POP4和POP7两个家系的遗传距离大于0.1,其他家系之间的遗传距离均小于0.1。但是家系内多态信息含量(PIC)大于等于0.5,说明家系内遗传变异较高。通过遗传距离和近交系数,可以推断家系内都存在近交、遗传距离较小的情况。这与大尾寒羊保种群原保种群并没有系谱记录,随机交配的情况相符合。综上所述:在大尾寒羊群体中,所选用的15个微卫星位点多态性较高。根据亲缘关系分析结果及测定的亲缘系数,可划分10个家系及构建家系系谱图。各个家系之间均有一定的遗传距离,大尾寒羊家系内遗传变异较高,家系内存在近交情况。