国土资源作为保障经济社会平稳健康发展的重要基础,是生态文明建设与绿色崛起的物质基础和重要载体。自然资源实行统一管理,对国家摸清资源家底、统筹管理资源能源有着重要意义。但自然资源部门初步建立,将面临更复杂的挑战,且我国政府系统组织结构现状及行政活动中的组织协调问题积存,同时地方自然资源管理部门仍未确立。因此,本文通过对地方自然资源行政管理部门内部组织设置,对比国土资源时期职能划分及在具体工作中暴露出来的职能重叠、权责不清等问题,思考如何通过优化内部组织之间的行政协调和配合,从而提升自然资源部门的行政效率。本文研究的主要内容与结论如下:(1)组建前国土资源管理行政组织存在不协调。结合佳木斯市的地理位置及自然资源结构,分析组建前相关行政组织及管理情况,对机构设置、人力资源配置进行分析,对比新的三定方案,得出组建前地方行政组织管理存在部门职能结构不明确,同级单位间沟通协助不理想,管理制度需进一步改革等问题。(2)组建后自然资源内部组织与管理存在新问题。通过分析组建后自然资源部门内部组织设置及相互关系、人员设置及匹配度,找出组建后自然资源行政管理面临的新问题,即地方机构不适应部门人员配置,部门三定方案与实际职能存在偏差,不能满足与时俱进的工作需要。(3)可建立多主体管理模式让各部门顺利过渡。在造成佳木斯市自然资源管理部门内部组织管理问题因素分析的基础上,提出需要建立一个多主体的管理模式,构建三步走的完善自然资源管理部门内部组织管理问题的管理模式,让各部门顺利过渡。并给出三方面保障措施,即加强信息沟通,建立职能培训机制,并深化改革力度。本文的研究成果从理论方面为地方自然资源行政管理部门内部组织与协调问题提供了有效支持,对促进自然资源可持续发展提供科学的理论依据。