大白菜抗病和晚抽薹性状的GWAS分析及其优异资源发掘

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 15次 | 上传用户:venus521
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蔬菜品种抗逆性、抗病性和品质的优劣是其成败的要素。而相关性状优异基因资源发掘是实现分子育种的基础。本研究以203份来源广泛、类型丰富的大白菜高代自交系为试材,进行了耐抽薹性和5种主要病害抗病性的人工控制环境下的鉴定,筛选出一批优良的大白菜育种材料;根据核心种质的重测序结果,开发了覆盖全基因组的SNP标记,并开展了全基因组关联分析,以挖掘控制这些性状的候选区段;对28份大白菜自交系或杂交组合进行感官品质和营养品质评价,并分析了两者的关系,为大白菜育种提供借鉴。主要研究结果如下:1.在6类不同形态类型的大白菜种质中,以合抱卵圆型材料的晚抽薹性最好;获得14份晚抽薹材料,其中以07-458和12-577开花最迟,从春化结束到开花分别需53天和41天。2.获得高抗霜霉病、病毒病、黑腐病、黄萎病和根肿病的材料分别有7、3、0、28和12个;兼抗2~4种病害的材料共计93个,并从中筛选到12-85、13-108和09-894等15个综合抗病性表现优异的自交系材料。3.基于10个核心种质的重测序数据,开发了覆盖全基因组的1040个SNP标记,并对203份材料进行基因分型和遗传结构分析;群体被划分为4个亚群,分别是合抱卵圆类亚群、叠抱平头类亚群、叠抱直筒类亚群和混合类型亚群;亲缘关系分析表明,自交系间两两亲缘关系系数在0.2以下的超过92%,表明群体亲缘关系较远。4.选用182份自交系材料组成的自然群体开展晚抽薹和5种病害的全基因组关联分析,分别获得与耐抽薹性、开花天数、霜霉病、病毒病、黑腐病、黄萎病和根肿病抗性显著关联的5、2、2、5、2、5和8个共计29个位点或热点区,为进一步发掘候选基因提供了依据。5.以28个自交系或品种为试材,筛选出了7个感官品质较好的自交系材料,并分析得到感官品质回归方程:生食综合yr=0.3103+0.254x1(多汁度)+0.1762x2(甜度)+0.2216x3(脆度)+0.3199x4(鲜味),熟食综合yc=0.2044+0.2509x5(渣量)+0.2469x6(甜度)+0.1825x7(绵软度)+0.3231x8(鲜味)。通径分析结果表明,多汁度和甜度对大白菜生食综合评价影响较大;甜度对熟食影响最大。获得营养品质预测的回归方程yr=-32.1920+0.3893x1(水分)+1.1698x2(可溶性糖),yc=7.4971+0.7326x2(可溶性糖)-5.6688x3(有机酸)-2.1763x5(粗纤维),可以水分和可溶性糖对生食,可溶性糖、有机酸和粗纤维对熟食品质进行预测。
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