【摘 要】
:
本论文通过改变培养方式、添加化学诱导剂(elicitor)、分析次级代谢产物合成基因簇,研究2株海洋来源链霉菌次级代谢产物的多样性。菌株经16S r DNA鉴定为灰略红链霉菌Streptomyces sp.FJNU027(FJNU027)和浅紫链霉菌Streptomyces sp.FJNU028(FJNU028)。海洋来源链霉菌FJNU027通过添加化学诱导剂,激活沉默基因簇,以增加其次级代谢产物
论文部分内容阅读
本论文通过改变培养方式、添加化学诱导剂(elicitor)、分析次级代谢产物合成基因簇,研究2株海洋来源链霉菌次级代谢产物的多样性。菌株经16S r DNA鉴定为灰略红链霉菌Streptomyces sp.FJNU027(FJNU027)和浅紫链霉菌Streptomyces sp.FJNU028(FJNU028)。海洋来源链霉菌FJNU027通过添加化学诱导剂,激活沉默基因簇,以增加其次级代谢产物多样性。在海洋来源链霉菌FJNU027培养过程中加入化学诱导剂,发现发酵液颜色发生变化,利用薄层层析(TLC)、高效液相色谱(HPLC)、液相色谱质谱联用(LC-MS)分析,发现在化学诱导剂suberoylanilide hydroxamic acid(SAHA)的作用下,增加了其次级代谢产物的多样性。利用antiSMASH分析海洋来源链霉菌FJNU027次级代谢产物合成基因簇,发现总共有25个潜在次级代谢产物合成基因簇,可能合成的产物包括5个萜类、3个PKS、2个四氢嘧啶类、2个NRPS、2个铁载体、1个羊毛硫肽类、1个吩嗪类、2个细菌素和1个丁内酯类及6个其他产物,且大部分都是未知次级代谢产物合成基因簇,或是具有极低相似性的已知次级代谢产物合成基因簇,因此海洋来源链霉菌FJNU027具有产生新颖次级代谢产物的潜力。对海洋来源链霉菌FJNU027中分离得到的5个新次级代谢产物与基因簇进行比对,大致确定了新次级代谢产物与基因簇的对应关系。海洋来源链霉菌FJNU028通过改变培养条件,激活沉默基因簇,以增加其次级代谢产物多样性。从28种培养基中筛选出一种发酵周期短,次级代谢产物丰富,具有良好抑制酿酒酵母活性的培养基:20%YPD培养基。以抑制酿酒酵母活性为指标,确定最佳发酵周期为4天。以抑制酿酒酵母活性为指标,确定500 m L三角瓶最佳装液量为450 m L。利用最佳培养方式发酵海洋来源链霉菌FJNU028 150 L,从中获得9.3 g具有良好抑制酿酒酵母活性的有机粗提物。海洋来源链霉菌FJNU028通过添加化学诱导剂,激活沉默基因簇,期望增加其次级代谢产物多样性。通过TLC、HPLC分析海洋来源链霉菌FJNU028次级代谢产物多样性变化,发现该菌株对化学诱导剂不敏感,未能出现新次级代谢产物。利用antiSMASH分析海洋来源链霉菌FJNU028次级代谢产物合成基因簇,发现总共有24个潜在次级代谢产物合成基因簇,可能合成的产物包括5个萜类、4个PKS、5个NRPS、3个细菌素、2个铁载体、1个类NRPS、1个羊毛硫肽类和1个四氢嘧啶类及2个其他产物,且大部分都是未知次级代谢产物合成基因簇,或是具有极低相似性的已知次级代谢产物合成基因簇,因此,海洋来源链霉菌FJNU028具有较大合成新次级代谢产物的潜力。本论文通过改变发酵方式和添加化学诱导剂来激活沉默基因簇,增加了海洋来源链霉菌FJNU027和FJNU028次级代谢产物的多样性。通过antiSMASH分析了海洋来源链霉菌FJNU027和FJNU028次级代谢产物合成基因簇,并对海洋来源链霉菌FJNU027中分离得到的5个新次级代谢产物与基因簇进行比对,大致确定了新次级代谢产物与基因簇的对应关系。本论文研究表明,改变发酵条件和添加化学诱导剂是增加目的菌次级代谢产物多样性的有效方法;本研究为海洋来源放线菌菌种资源的充分利用提供了参考依据。
其他文献
嗜肺军团菌通过其特有的ⅣB型(Dot/Icm)分泌系统将约330种效应因子转运到宿主细胞内,逃逸宿主免疫系统的监测、完成自身增殖,同时引发严重的军团菌病。本论文的研究对象Lem23(另称为lpg2406)是嗜肺军团菌经Dot/Icm分泌系统转运到宿主细胞内的一种效应蛋白。为了探索Lem23在嗜肺军团菌入侵宿主细胞过程中的功能,以及寻找其在宿主细胞内的作用靶点,我们解析了Lem23的结构,并对其功能
长链多不饱和脂肪酸在人类健康中起着重要作用。特别是二十碳五烯酸(EPA)和二十碳六烯酸(DHA)对脑功能发育和心血管疾病有显著的作用。三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)是一种无异味、易于培养、繁殖快且EPA含量丰富的海洋硅藻,也是研究EPA合成的理想模式生物。从分子生物学角度探究三角褐指藻积累EPA和DHA合成的分子机制,借助相关分子遗传育种手段提高EPA和DHA产量
随着测序技术的发展,产生的序列数据量越来越多,如何从海量生物数据中挖掘有利信息,是生物学研究面临的一个挑战。用低维、核心特征来表示序列,有利于提高计算效率,是解决上述问题的一种有效手段。本文研究了生物序列的特征提取和特征选择技术,将它们应用于微生物水平基因转移预测和生物序列聚类领域中,主要围绕以下3个方面开展工作:1.针对其他水平基因转移预测方法计算准确度不高的问题,提出了一种基于降噪自编码器、集
CRISPR-Cas系统是一种由RNA引导的适应性免疫系统,可保护细菌和古生菌免受噬菌体及其他外源核酸物质的入侵。已经鉴定的CRISPR-Cas系统具有丰富的多样性,可分为两个大类。其中,第二大类CRISPR-Cas系统是通过单个多结构域的Cas效应蛋白与cr RNA(CRISPR RNA)形成复合物,从而发挥其RNA引导的核酸内切酶活性。目前,由第二大类II型CRISPR-Cas9系统和V型CR
福建境内有野生兰78属170种以上,大多种类的野生资源稀少,分布区域狭窄、生境特殊。密花鸢尾兰(Oberonia seidenfadenii)和小毛兰(Conchidium sinicum)均为近些年来在福建境内发现的新记录种,为附生野生兰,前者已知分布点极少,后者株型矮小、生境特别,均能正常开花,但结实低。植株矮小,花更小,造成其分类归属问题存在争议。另外,随着山区旅游业的开发及药用价值的挖掘,
隐花色素(cryptochrome)是一类重要的蓝光受体,广泛存在于各种动植物、细菌等生物体内。隐花色素对植物的色素累积、叶绿体形成等相关生理生化活动起到重要作用。研究表明,蓝光可参与调控莱茵衣藻叶绿素及类岩藻黄素合成等相关生理过程,球等鞭金藻富含岩藻黄素(fucoxanthin)和多不饱和脂肪酸等代谢产物质,因此蓝光及隐花色素基因对球等鞭金藻上述代谢物质合成积累应该起到积极调控作用。本实验通过查
微生物脂肪酶盖子(Lid)结构域覆盖在脂肪酶活性中心的上方;具有无盖、单盖和双盖等多种结构形式;在油-水界面,盖子结构通过其构象的变化,控制活性中心的开放与关闭,致使脂肪酶表现出独特的“界面激活(Interfacial activation)”的催化特性。除了与界面激活的催化特性密切相关外,盖子结构还影响到脂肪酶对底物的选择性、脂肪酶的热稳定性等多种特性。伯克霍尔德菌(Burkholderia s
研究目的:TOX2是一种转录因子,属于TOX家族。虽然TOX2已被证明在NK细胞的发育过程中发挥重要的作用,但对TOX2在淋巴细胞发育过程中的作用仍知之甚少。利用CRISPR/Cas9基因编辑技术构建TOX2基因敲除小鼠模型,能对其功能和作用进行深入研究。研究方法:具有设计简单,效率高等优点的CRISPR/Cas9基因编辑技术成为了目前发展最为迅速的基因编辑技术。本研究通过CRISPR/Cas9基
在一系列生理过程中,活性硫物种(Reactive Sulfur Species,RSSs)可通过特定的酶进一步代谢为H2S、Sn2-、SO32-、HSO3-、S2O42-和S2O52-等活性无机硫物种(Reactive Inorganic Sulfur Species,RISSs)。RSSs及其代谢物RISSs在抗氧化应激和其他生理事件中起着至关重要的作用。它们如何影响细胞信号转导和其他生理事件的
微藻是富有潜力的可再生生物柴油原料,具有单位油脂产量高、不与农田争地、可协同二氧化碳固定等优势。但到目前为止微藻生物柴油并未实现广泛的商业化运用,昂贵的培养成本和采收成本使其产品价格缺乏对传统石化柴油的竞争力。用猪沼液作为培养基可将污水治理与微藻生物质生产相结合,是降低微藻生物柴油价格的可行性策略,但如何从猪沼液低成本采收微藻依然是亟待解决的问题。在众多采收方法中,真菌菌丝球絮凝法采收微藻具有以下