作为传统的中药材之一，淫羊藿目前入药的多为野生资源，但质量参差不齐，不同物种或同一物种不同地理来源的淫羊藿所含活性成分的种类和含量都有很大差异，这给选育优质淫羊藿资源带来了很大的困难。为研究不同环境对于淫羊藿活性成分积累的影响我们开展了同园栽培实验，研究遗传和环境因子对淫羊藿次生代谢产物积累的影响，并对差异产生的原因进行了探讨。　　 实验表明在经过多年的同园栽培后，不同淫羊藿物种以及箭叶淫羊藿不同品系间的活性成分种类及含量仍有较大差异，相同的栽培环境并没有完全消除种间及品系间的差异，揭示了遗传因素是淫羊藿次生代谢产物积累的主要影响因子。但在经过移栽之后，不同的环境对淫羊藿产生了一定的影响。不同淫羊藿品系在北京、武汉、广州三地的成活率有较大的差异，表现出了不同的适应性。不同品系在三地间的活性成分种类没有发生改变，但含量发生了变化。不同品系在年份间的稳定性也不同，其中LT1、GX1、SC1因具有较好的适应性和稳定性且活性成分含量较高都可考虑作为优质资源进行大规模栽培。淫羊藿主要活性成分与环境因子的灰色关联度分析结果显示日平均日照时数是影响活性成分积累的主要环境因子。　　 本实验利用甲基化敏感扩增多态性方法(Methylation-sensitive amplifiedpolymorphism，MSAP)对三地淫羊藿基因组DNA甲基化进行分析，武汉的淫羊藿样品的半甲基化水平、全甲基化水平及总体甲基化水平均高于北京和广州相同基因型植株。实验回收并克隆了部分差异片段进行测序再进行序列比对，其中两个为叶绿体基因组序列，另一个是Lpxc脱乙酰酶序列，其他序列在数据库中没有显著同源的序列。　　 淫羊藿四种活性成分及其总含量与各甲基化型比率及甲基化水平间的相关性分析结果显示，活性成分含量与甲基化水平之间存在正相关关系。揭示了DNA的甲基化程度可能影响了淫羊藿的次生代谢产物的积累。