当前,我国改革逐渐由经济领域向着社会领域发展,基层社会治理的方式和结构正反生着巨大的变化,多种利益关系错综复杂,利益结果不断改变,利益差距不断扩大。从前计划经济时代政府统一组织基层社会治理的模式已不能适应社会发展的需要,这就要求我国基层社会治理的机制不断创新,按照现实社会的要求,实现基层社会治理主体的多元化。社会组织是政府联系群众、接连市场、了解基层社会的桥梁和纽带,是构建科学化、民主化社会管理体系,推进社会管理创新的重要因素。本文首先介绍了论文的选题背景以及选题意义,对国内外研究成果进行梳理总结。对公民社会理论、政府失灵理论、市场失灵理论、合作主义理论、善治理论进行分析,为社会组织参与农村社区治理机制构建提供了理论上的支持,结合舟山新区实际情况,对社会组织参与农村社区治理进行了研究。其次,分别从多个角度对社会组织现阶段出现的问题进行分析,总结社会组织参与基层社会治理所面对的问题。文章最后针对社会组织发展所面对的困境,从社会组织自身建设、外部环境建设等方面提出积极对策,最后在全文基础上,总结创新社会组织参与农村社区治理的体系构建。以达到使社会组织更充分的发挥其在基层社会治理中的作用,提升基层社会管理水平,希望对我国社会组织参与基层社会治理相关研究做出一点贡献。