2000年我国从江苏试点开始对农村信用社进行股份制制度变迁,成立三家县级农村商业银行,之后全国各地纷纷构建农村商业银行来服务于当地的“三农”金融,农村商业银行也着实为其所在地的农村稳定、农业增长和农民增收做出了很大贡献。农村商业银行也在这十几年的服务中全面提高了自身的水平,其盈利能力、资产质量、银行治理都有较大改善,可以说“三农”问题的解决和农村商业银行的进步相辅相成。2010年12月,重庆农村商业银行在香港上市,拉开了农村商业银行上市的序幕,内地许多发展较成熟的农村商业银行都开始着手进行上市准备。农村商业银行正在迈向更加具有活力和竞争更加激烈化的市场。我国的银行业体系对银行有不同的分类,然而无论是国有商业银行还是股份制商业银行还是城市商业银行亦或农村商业银行,作为银行,其本质上都是经营风险的组织,经营风险以期获得风险收益。所以在万变的金融环境和激烈的市场竞争中,如何减少、规避自身的风险,已经成为所有银行亟待解决的重要问题。本文的研究主题是农村商业银行的风险,本文最主要的研究方法是对比研究和因子分析实证研究。对比研究和实证研究主要表现在：首先,本文的研究对象是农村商业银行,而它是由农村信用社制度变迁而来,本文对比了制度变迁前后的产权制度与管理体制；其次,本文所讨论的农村商业银行风险是把农村商业银行作为一个整体来进行风险研究,根据商业银行风险理论,给出影响农村商业银行风险的指标体系,然后采用因子分析法对31家样本银行进行风险的实证分析。为了突出农村商业银行作为整体与我国银行体系内其他类型银行的风险差异,本文选取了5家国有银行,5家大型股份制商业银行,5家城市商业银行和16家农村商业银行来进行总体分析。运用因子分析模型,把多指标降维,提取出影响银行风险的主要因子,对它们打分并给出排名,再分别对它们进行结果分析。最后针对农村商业银行的主要风险影响因子结合现实中管理风险的经验,从银行微观层面和国家制度层面提出有针对性的规避建议。全文共有五章,具体结构和内容安排如下：第一章是引言。主要阐述了本文的研究背景和研究意义,描述了我国农村合作制度的制度变迁；然后介绍了本文写作的相关研究思路与研究方法,介绍采用的研究方法是对比研究,实证研究等,本文研究的创新点和不足也包括在这一章。第二章是理论基础与文献综述。本文的理论基础包括制度经济学中的产权理论和制度变迁理论也包括金融学中的银行风险理论,本章对它们进行了简单的介绍。而后基于本文的写作目的,翻阅了国内外对于农村商业银行风险的研究现状,并对它们进行梳理。第三章是制度变迁下的农村商业银行风险。本章简单介绍了农村商业银行制度的形成过程,它是由其前身农村信用社经过制度变迁而来,制度变迁前后的产权制度和管理体制也有涉及,但是制度变迁并不是一劳永逸的,农村商业银行制度形成后存在的风险是本章要探讨的主要内容。第四章是基于因子分析法来对我国的农村商业银行风险进行评估。影响农村商业银行的风险指标有很多,包括不良贷款率、贷存比、成本收入比等,但是若每个指标都考虑,计量分析就失去了存在的意义,本章选取了影响商业银行风险的一些指标,根据指标相关性来进行降维,选取出主要的五个因子,并对其进行结果分析。第五章是规避农村商业银行风险的对策建议。根据第四章的实证分析结果,再结合商业银行规避风险的经验教训,综合规避建议,这些建议既包括农村商业银行自身的作为,也包括宏观制度层面的国家行为。