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麻疯树(Jatropha curcas Linn)是大戟科(Euphorbiaceae)麻疯树属(Jatropha)植物,原产于墨西哥,种子含油,可加工成生物柴油,是优良的生物柴油树种。目前,对麻疯树的研究主要集中在生物柴油产量、化学成份和毒理学等领域,分子生物学和遗传学方面的研究在国外内的报道也较少。本研究用AFLP分子标记技术对来自云南和四川的10个麻疯树野生居群200个样本的遗传多样性、遗传分化和遗传结构进行分析,其主要内容及研究结果如下：1.采用改进的CTAB法从从麻疯树嫩叶中提取DNA。通过琼脂糖凝胶电泳、核酸蛋白测定仪和AFLP扩增对DNA进行检测,结果得到的DNA完整性好；OD值260/280均在1.80-1.95之间,DNA浓度较高、纯度好,扩增产物的电泳图谱清晰,适合用于麻疯树AFLP分析。2.选择EcoRI/MseI这一酶切组合,选用多态性高、分辨力强的引物组合E6M4、E6M6、E8M1、E8M6、E8M8分别对供试材料的基因组DNA进行选择性扩增,共扩增出417个遗传位点,其中352个多态位点,多态率为84.4%；麻疯树居群所检出的位点平均有效等位基因数(Ae)、Nei’s基因多样度(H)、平均Shannon信息指数(I),分别为1.6819、0.5559和0.6665。3.居群间的遗传分化系数(GST)为0.0656,表明10个麻疯树居群的变异主要存在于居群内,分子方差分析(AMOVA)的结果与以上分析结果基本一致。4.从Nei’s遗传距离和遗传一致度分析了各供试资源间的亲缘关系,10个居群的UPGMA聚类图反映了供试材料的亲缘关系：首先是云南双柏(YNSB)、四川会理(SCHL)、四川会东(SCHD)等八个居群与四川花棚子(SCHPZ)、四川金河(SCJH)两个居群分开,聚为两个大类；在云南双柏(YNSB)、四川会理(SCHL)、四川会东(SCHD)等八个居群中,云南双柏(YNSB)和其余七个居群分成两个亚类,其中四川雷波(SCLB)和云南西双版纳(YNXSBN)显示出了最近的亲缘关系。经SPSS分析表明居群间的遗传距离与地理距离相关性不明显,说明地理位置条件对遗传结构没有有明显的影响。