波棱瓜子为常用藏药。藏医在临床用于治疗赤巴病，尤其是热性赤巴病，治疗肝、胆疾病及消化不良。已载入《中国药典》80版-2000年版附录及《部颁药品标准》（藏药）第一册中。 通过文献查考，表明至少在公元八世纪波棱瓜就已作药用。古今用药品种基本一致，为葫芦科植物波棱瓜Herpetospermum pedunculosum（Ser.）C.B.Clarke.（H caudigerum Wall.）的干燥成熟种子。有文献记载，在个别地区有用同科其它种的种子误作波棱瓜子药用。 药源调查结果表明，波棱瓜子各地用药品种基本一致，为波棱瓜的干燥成熟种子，但在西藏、云南、甘肃、四川的甘孜、阿坝州部分地区有将同科不同属的苦瓜Momordica charantia L.、西藏赤爬 Thladiantha setispina A.M.Lu et Z.Y.Zhang、木鳖子Momordica cohinchinensis（Lour.）Spreng．等的种子误作波棱瓜子药用。 本课题首次系统地对波棱瓜子、木鳖子、苦瓜子、西藏赤爬种子进行了生药学研究，结果表明，能通过原植物、药材性状、种子组织、粉末特征将它们准确鉴别开来。 化学成分系统预试表明，波棱瓜子含有皂苷、氨基酸、蛋白质、三萜类和脂肪等成分。波棱瓜子与其伪品可通过Liebermann反应、发泡性反应、皂苷薄层色谱、蛋白电泳色谱等予以鉴别。 首次对波棱瓜子进行了药效学初步研究，结果表明，波棱瓜子的活性物质主要集中在氯仿、正丁醇两部分，波棱瓜子具有清热解毒、抗炎、利胆等生物活性，在以后的进一步研究中应重点研究氯仿、正丁醇两部分的药效作用物质基础。急性毒性试验表明，水提物的小鼠最大耐受量为635倍以上，提示水提物毒性较低，醇提物的LD₅₀为98g／Kg。 波棱瓜子为常用藏药，疗效确切，需要量大，供不应求。国家中医药局已于1999年立项进行野生变家种试验研究。目前尚无人对其进行系统的深入研究，本课题的研究有利于波棱瓜子规范化质量标准的制定，并为进一步进行深入研究和开发利用提供了科学依据。