识别组蛋白甲基化修饰的转录调控因子MRG15及钩端螺旋体α-甲基苹果酸合酶的结构与功能研究

来源 :中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所 中国科学院上海生命科学研究院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:collinne
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
转录调控因子MRG15在人的组织中广泛表达,与其同源蛋白组成了MRG蛋白家族。MRG15在胚胎发育和细胞增殖中发挥着重要功能,并且参与细胞衰老生命过程的调控。MRG15的N端包含一个参与染色质修饰调控的Chromo结构域,C端存在一个保守的MRG结构域。Chromo结构域多存在于染色质修饰相关的蛋白质中,其功能为识别组蛋白甲基化修饰;MRG结构域则是MRG蛋白家族的特征结构域。为了研究MRG15发挥功能的分子基础,我们分别解析了MRG15 Chromo结构域(MRG15N)和MRG结构域(MRG15C)的高分辨率晶体结构。MRG15N由一个β桶状结构外加C端一个α螺旋组成,在β桶状结构顶部存在一个由保守氨基酸Tyr26、Tyr46及Trp49组成的疏水口袋,结构上与果蝇中的组蛋白甲基转移酶MOF的Chromo结构域非常相似。与已知的HP1/Pc中的Chromo结构域相比,MRG15N的明显不同之处在于对应于HP1/Pc中9位赖氨酸甲基化组蛋白H3的结合位置被其自身的β1所占据。MRG15c主要是由α螺旋组成的三明治状结构,表面以疏水氨基酸为主。基于结构的功能分析揭示:MRG15N可以结合36位赖氨酸甲基化的组蛋白H3,结合位点位于顶部疏水口袋区。MRG15c则利用其表面由Ile160、Leu168、Val169、Trp172、Tyr235和Va1268组成的疏水口袋结合PAM14(MRG15associated protein,14 kDa)N端(前50个氨基酸)区域。我们的研究结果揭示了MRG15与PAM14之间相互作用的分子机制,并且表明MRG15可以通过结合36位赖氨酸甲基化的组蛋白H3从而在转录调控及染色质修饰中发挥重要功能。 在大多数生物体内,异亮氨酸的合成是通过苏氨酸途径进行,这一途径中的关键酶为苏氨酸脱氢酶。然而在钩端螺旋体等少数微生物中并没有发现相应的酶,异亮氨酸合成的替代途径-丙酮酸途径逐渐被发现并得到确证。α-甲基苹果酸合酶(Gitramalate synthase,CimA)是这一途径的关键酶,它负责催化丙酮酸途径中的第一步反应:丙酮酸与乙酰辅酶A生成α-甲基苹果酸,这一反应属于C1aisen酯缩合反应。钩端螺旋体α-甲基苹果酸合酶(LiCimA)包含两个结构域:N端催化结构域和C端调节结构域,以二聚体形式发挥功能,反应受终产物异亮氨酸的反馈抑制。LiCimA所催化的反应与来源于结核分枝杆菌的α-异丙基苹果酸(MtLeuA)合酶(催化异亮氨酸合成途径中第一步反应)催化的反应相似。为了阐述LiCimA的底物特异性、催化机制及反馈抑制机制等问题,我们解析了LiCimA催化结构域及其底物复合物的结构、调节结构域与反馈抑制物异亮氨酸复合物的结构。通过与已知结构的分析比较以及相应突变体的酶活测定,揭示了:(1)LiCimA底物识别的特异性取决于底物结合部位由Leu81、Leu104及Tyr144组成的疏水凹槽;(2)LiCimA与MtLeuA的结构及组成活性中心的氨基酸都非常相似,有着相似的催化机制,整个反应过程分三步进行:烯醇化、缩合、水解;(3)反馈抑制物异亮氨酸结合于调节结构域二聚体的接触面上,负责与异亮氨酸结合的Tyr430、Tyr454、Leu451、Ile458、Val468来源于两个单体,决定了其结合的特异性;(4)反馈抑制机制:异亮氨酸与调节结构域的结合最终导致了催化结构域二聚体的构象变化,影响了催化结构域与乙酰辅酶A的结合,使反应过程受阻。由于丙酮酸途径的独特性,得到的研究成果可以指导以α-甲基苹果酸合酶为靶点的抗微生物药物的设计。
其他文献
随着电力电子器件以及数字信号处理芯片的快速发展,三相感应电机交流调速技术得到了极大的提高,与三相交流调速系统相比,多相电机交流调速系统具有低电压大功率、系统的可靠性极高以及电磁转矩脉动小等优点,在供电电压的等级受到限制的场合,要实现中大功率驱动,使用功率器件的串并联必然会带来均压或均流等复杂问题,多相电机交流调速系统在这方面优势更为突出,目前,多相电机调速系统侧重于舰船推进系统、大功率及其高可靠性
真核细胞中,DNA作为遗传物质主要以染色质的形式存在于细胞核中。核小体是真核生物染色质的基本结构单元,由核小体串珠形成的11 nm染色质纤维是染色质的初级结构。核小体串珠可
用五点采样法从福建九龙江口、广东湛江特呈岛及深圳福田、广西北海以及海南的三亚、儋州、清澜港、东寨港等8个地点的红树林采集了8份红树林土壤样品,利用链霉菌的系统发育特
随着世界人口老龄化问题的加剧,脑老化以及神经退行性疾病带给人们的威胁越来越大。美国Marist民意调查机构在1247名成年人对于衰老的调查显示,比起容颜消逝以及其它疾病,82%的民
H2A.Z是真核生物中序列高度保守的组蛋白变体,缺失H2A.Z导致酵母的生长缺陷,以及果蝇、小鼠的胚胎致死。研究表明H2A.Z在基因转录与复制,DNA修复,基因组稳定性等多种生命过程中发
语文阅读能力提升,对于学生语文总体水平的提升是非常关键的,可以说,在语文学习中,得阅读者得天下,因为不管我们是做基本的文言文赏析,还是现代文阅读,甚至是作文等的解题,只有在阅读
蚜虫类Aphidinea隶属于半翅目Hemiptera,包括卵胎生的蚜科Aphididae以及卵生的球蚜科Adelgidae和根瘤蚜科Phylloxeridae。该类昆虫大多数生活在北半球的温带和亚热带地区,世界
开关磁阻电机是近几十年来发展起来的电机,由于其结构简单、成本较低、可靠性高、调速范围宽等优点得到了越来越多的关注。由开关磁阻电机构成的开关磁阻电机驱动系统成为继变频调速系统、无刷直流电机调速系统之后发展起来的新一代无级调速系统,其将磁阻式电机和现代电力电子技术相融合,是典型的机电一体化产品,它兼具直流、交流两类调速系统的优点。也正是开关磁阻电机相比于传统的交直流电机的诸多优点,使其越来越受到人们的
目前,世界正在经历着快速的城市化、工业化和全球化。全球变化的速度、范围和深度正在从局地、区域和全球等不同尺度直接影响人类赖以生存的生态系统。人类活动导致的大气总悬
木质物残体(WD)在维持森林生态系统生物多样性、稳定性,参与森林生态系统养分循环、碳循环,促进群落更新演替及生态系统平衡等方面发挥重要作用。本文以长白山阔叶红松林为对象