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着丝粒作为真核生物染色体上必备的功能元件,参与动粒的组建、染色体的分离、姊妹染色单体的粘合、同源染色体的配对等重要生物学过程。着丝粒序列主要是由反转座子以及卫星重复组成,但在不同的物种间甚至是在近缘物种间呈现高度变异,因此,难以克隆分析。本研究通过基于着丝粒上具有的特异组蛋白CENH3(centromeric histone H3;亦称CENP-A)的染色质免疫沉淀和高通量测序分析(ChIP-seq),开展了四倍体棉D基因组祖先种雷蒙德氏棉着丝粒DNA的发掘与分析。结果显示:(1)该棉种着丝粒内具有