事业单位的人力资源问题始终是改革开放以来的热点话题。随着我国事业单位改革的不断深入,科研机构人事管理制度改革已经全面进入实施阶段,但是随着国家对科技工作需求的不断加深,科技人才队伍建设暴露出诸多管理问题。尤其是在公益性事业单位体制机制的大背景下,相对于日益加强和逐步完善的行政人员绩效考核而言,科研人员的绩效考核工作显得相对滞后和软弱,缺乏行之有效的绩效管理机制。在新的历史时期,如何根据我国公益科研事业发展的内在需求,以“以人为本”的思想为指导,全面地加强和改进科研人员的绩效考核,使科研单位的行政人员的绩效考核真正的做到富有“绩效”,这是当前科研单位改革和管理过程中面临的关键课题。本研究在探讨绩效考核基本原理之上,深度剖析了 JK研究院的基本情况,组织结构、人员比例、发展战略、业务模块、科研人员特点、绩效考核管理现状和存在问题。基于KPI等绩效考核方法对JK研究院,开展科研人员的工作分析,根据JK研究院整体发展战略目标,对JK研究院科研人员绩效考核管理进行改进和优化,研究出JK研究院科研人员绩效考核的目的、设计思路、设计流程,选择并确立绩效考核指标以及其具体实施措施,探讨富有建设性的绩效考核机制,全方位增强JK研究院开展绩效考核的效果。在绩效考核相关理论探讨之上,研究出确保JK研究院科研人员绩效考核管理顺利执行的若干保障措施。