云南省两个地区地中海贫血流行病学调查及新发现地中海贫血突变类型的研究

来源 :昆明理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sky007
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目的:了解地中海贫血(简称地贫)在云南省德宏州、西双版纳州傣族育龄人群和盈江、勐腊0-7岁儿童中的基因携带率、突变类型及频率。报道1例新发现的α-地贫、2例新发现的β-地贫以及2例大片段缺失型β-地贫,对其血液学特征进行分析。为出生缺陷防控提供理论依据。方法:对云南省德宏州、西双版纳州1614例傣族育龄人群和盈江、勐腊590例0-7岁儿童进行血常规检测、血红蛋白电泳分析、珠蛋白基因二代测序。运用SPSS 17.0对实验结果进行数据分析,分析过程中应用独立性样本t检验、ROC曲线分析。采用二代测序技术检测了3名个体中的新发现珠蛋白基因突变,并通过珠蛋白基因的Sanger测序进行验证。运用血常规检测、血红蛋白电泳分析其血液学特征。生物软件分析突变的等电点、分子量、保守性及蛋白突变的致病性。2例大片段缺失β-地贫进行血常规检测、血红蛋白电泳分析以及珠蛋白基因的二代测序。运用MLPA技术检测新发现的缺失型β-地贫基因突变,并通过珠蛋白基因的Sanger测序进行验证。结果:1、云南省两个地区地中海贫血流行病学调查(1)德宏州和西双版纳州受检傣族育龄人群共1614例,检出地贫携带者共809例,携带率为50.13%(809/1614),其中α-地贫的携带率为33.09%(534/1614),β-地贫的携带率为10.66%(172/1614),α合并β-地贫的携带率为6.38%(103/1614)。盈江和勐腊受检0-7岁儿童共590例,检出地贫携带者共211例,携带率为35.76%(211/590),其中α-地贫的携带率为21.69%(128/1614),β-地贫的携带率为10.51%(62/590),α合并β-地贫的携带率为3.56%(103/590)。德宏州和西双版纳州受检傣族育龄人群中α-地贫最常见的基因突变类型是-α3.7,其次是--SEA;β-地贫最常见的基因突变类型是CD26(G>A),其次是CD17(A>T)。盈江和勐腊受检0-7岁儿童中α-地贫最常见的基因突变类型是-α3.7,其次是--SEA;β-地贫以CD26(G>A)最为常见,其次是CD41/42(-TTCT)。(2)对确诊的成人地贫的患者血液学参数进行比较,α-地贫中αα/--SEA的MCV值较低,αα/αCSα的Hb A2值较低;β-地贫中CD41/42(-TTCT)的MCV的值较低;α合并β-地贫中αα/-α3.7合并CD26(G>A)的Hb A值较低。对确诊的0-7岁儿童地贫患者的血液学参数比较,α-地贫中αα/--SEA的Hb A2值较低。成人男性样本与儿童男性样本的血液学特征进行比较,儿童Hb低于成人,成人女性样本与儿童女性样本的血液学特征进行比较,儿童MCH低于成人。(3)成人地贫MCV的最佳截断值为84.15 fl,敏感度为81.1%,特异度为85.8%;MCH的最佳截断值为27.95 pg,敏感度为86.8%,特异度为84.3%。0-7岁儿童地贫MCV的最佳截断值为76.95 fl,敏感度为79.2%,特异度为81.4%;MCH的最佳截断值为25.36 pg,敏感度为89.8%,特异度为78.1%。(4)成人与儿童中以MCV<80 fl或MCH<27 pg或Hb A2异常为筛查阳性判别标准时,特异性最低;以MCV<80 fl或MCH<27 pg和Hb A2异常为筛查阳性判别标准时,地贫筛查特异性较高。2、1例新发现的α-地贫和2例新发现的β-地贫(1)家系1的先证者是一名携带HBA2:c.54del C的26岁女性,血液学参数表现为小细胞、低色素性贫血,其母亲和姐姐中未发现,并通过珠蛋白基因的Sanger测序进行验证。(2)家系2是HBB:c.373C>A杂合突变,导致氨基酸改变(Pro>Thr),其血液学表型正常。先证者的母亲也被证明是HBB:c.373C>A突变的携带者,而其父亲和弟弟是正常个体。所有样本经过Sanger测序进行验证。通过在线生物信息学分析该突变对珠蛋白功能的影响以及对蛋白质结构和功能的影响,CD124(Pro124,HBB:c.373C>A)中的Pro氨基酸在十个物种中均保守,生物软件提示HBB:c.373C>A突变是有害的。(3)家系3为HBB:c.40G>A杂合突变,CD13中的点突变c.40G>A,导致氨基酸改变(Ala>Thr),其血液学表型正常,其母亲和姐姐是正常个体。所有样本经过Sanger测序进行验证。通过在线生物信息学分析该突变对珠蛋白功能的影响以及对蛋白质结构和功能的影响,CD13(Ala13,HBB:c.40G>A)中Ala氨基酸的仅在五个物种中保守,生物软件提示HBB:c.40G>A突变为良性的。3、2例大片段缺失β-地贫(1)家系4先证者为一名6岁的女性,为中重度贫血,进行珠蛋白基因的二代测序发现存在大片段的缺失以及CD41/42(-TTCT)突变,进行MLPA检测结果显示缺失范围HBB外显子1(148nt)-HBB下游基因(173nt),先证者大片段缺失遗传自其父亲,CD41/42(-TTCT)突变遗传自其母亲。(2)家系5的先证者是一名2岁的女性,表现为小细胞低色素贫血,进行珠蛋白基因的二代测序发现存在大片段的缺失,进行MLPA检测结果显示缺失范围HBG1外显子3(436nt)-OR51V1(486nt),先证者大片段缺失遗传自其母亲。结论:1、云南省德宏、西双版纳地区属于地贫高发的地区,傣族属于地贫高发的民族;2、α-地贫携带率大于β-地贫,多数α-地贫或β-地贫的临床表现为无症状或者轻型;3、静止型地贫突变无法通过常规方法进行筛选,NGS是一种更有效的静止型地贫筛选方法;4、一些罕见的大片段缺失地贫,常规的试剂盒无法检测,可能会导致漏诊,再生育出中重度贫血的患儿,使用NGS,结合血常规、血红蛋白电泳结果进行综合分析可以避免误诊。
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