基于Meta分析及TCGA数据分析间皮素在卵巢癌中的诊疗价值及分子机制研究

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目的评价血清间皮素在卵巢癌中的诊疗价值及相关分子机制分析方法通过检索Pubmed、Embase、Cochrane、Medline、CBM、中国知网、万方等数据库(截至2019年10月),根据纳入和排除标准,选取关于间皮素诊断卵巢癌的临床研究,将灵敏度、特异度等指标进行汇总分析。利用Revman 5.3软件进行系统质量评价,进行meta回归分析各协变量之间的一致性,统计学分析使用Stata14.0软件。同时利用GEPIA和Oncomine分析卵巢癌组织和正常卵巢组织中的间皮素MSLN基因表达水平差异,从TCGA数据库获取卵巢癌患者的RNA-Seq数据和相应临床数据,分析MSLN基因表达与患者临床特征的关系,利用Kaplan-Meier分析间皮素与卵巢癌患者预后的关系。依据MSLN表达水平将患者分为高表达组和低表达组,筛选差异基因,通过STRING构建关键基因的蛋白-蛋白网络结构、分析GO富集和KEGG通路,利用GCBI工具预测相关分子机制,进而分析间皮素在卵巢癌中的可能作用机制。结果本研究经检索筛选共纳入20篇文献,包括1304例卵巢癌,对照组2687例。利用TCGA数据库共获取498例卵巢癌患者的RNA-Seq数据和临床数据。1.间皮素用于卵巢癌诊断的灵敏度为0.69,特异度为0.94,综合受试者工作曲线的曲线下面积为0.93,诊断比值比为37。2.阈值效应非本研究显著异质性原因,亚组分析显示研究来源国、阈值设定方式及ELISA检测试剂为异质性的主要来源。3.利用GEPIA工具,我们发现与正常卵巢组织相比,MSLN基因在卵巢癌组织中的表达水平显著增高,Oncomine数据显示MSLN在不同组织类型的卵巢癌中呈高表达。TCGA数据分析显示MSLN表达水平与年龄、疾病分期、病理分级、脉管浸润及肿瘤是否残留无显著相关,而与肿瘤状态显著相关。4.MSLN高表达卵巢癌患者中位无进展时间为18.17个月,而低表达组为21.12个月(p=0.058);高表达组中位总生存时间为1484天,低表达组1583天(p=0.137)。5.通过对MSLN高表达组和低表达组基因组分析,共筛选出50个差异基因,GO功能分析显示差异基因涉及的生物过程主要为有丝分裂细胞周期、参与有丝分裂的微管细胞骨架组成和细胞分裂。KEGG分析显示所涉及的通路为p53信号通路。6.蛋白-蛋白结构网络分析示MSLN、MUC16、FOLR1及UPK3B间存在关联。尤其是MSLN、MUC16和FOLR1构成相对闭合的三角信号循环。MSLN的表达与MUC16、FOLR1、UPK3B呈正相关,GCBI分析显示MSLN/MUC16、MSLN/FOLR1、MSLN/UPK3B存在多种共同转录因子。结论间皮素在卵巢癌中具有潜在的诊断效能,其在卵巢癌患者中的高表达使其可能成为预测卵巢癌患者预后的重要标志分子,但需进一步大规模的前瞻性研究去验证。MSLN/MUC16、MSLN/FOLR1、MSLN/UPK3B间的互相作用关系可能为卵巢癌的诊断和治疗提供潜在的分子靶点。
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