计算机软件反向工程是一个逆向分析的过程，是一项针对软件的目标程序进行反向研究的工作。反向工程主体在这种逆向思维的主导下，由目标程序入手，导出他人软件开发的基本构成要素。关于计算机软件反向工程合法性问题的讨论和争执一直没有停止，本文主要从著作权法、法经济学等角度，全面论述软件反向工程的合理性。其中，由于软件反向工程中存在着与侵权相连的“灰色地带”，这使得反向工程行为与侵权行为在某些情况下很难区分，本文认为很有必要厘清两者之间的关系，使两者之间的界线清晰化以避免混淆。另外，关于计算机软件的保护模式，目前主要是采用著作权的保护模式，但实践中商业秘密保护模式、合同法保护模式也是软件权利人经常选择的方式，本文分别分析了不同保护模式下的利弊以供对比和研究。并且，专利法保护模式由于其对计算机软件的保护更加具有针对性，而逐渐受到更多软件权利人的关注和青睐，未来的软件保护模式势必将不断的拓宽和发展。软件反向工程具有重大的现实意义，它在带动创新、推动科技发展、刺激竞争等众多方面均有着重要地社会意义。当今我国软件产业发展势头良好，有关软件反向工程的认识问题更应该提升到新的高度。不仅如此，反向工程更体现了知识产权的利益平衡机制，在平衡软件著作权人利益和公共利益方面起到了举足轻重的重要作用。然而，我国的相关立法还存在着很多的空白，现有法律的模糊性也有待进一步完善和商榷。因此，我国有必要借鉴国外先进立法，对我国反向工程的实施条件作详细分析，充实完善相关立法，以尽快在立法中明确反向工程行为的法律性质、丰富其内容，从而尽快确立反向工程的合法性。