企业在技术创新过程中,企业内外各创新要素(或子系统)的系统集成,是各种要素(或子系统)的非线性组合和动态整合。企业技术创新系统可以被分为核心层次、辅助层次、外围层次三层次。企业技术创新系统的运行过程是一项集技术、生产经营、管理于一体的特殊的社会实践活动,因而更要强调企业技术创新系统要之间的合作性、协调性、同步性,表现为企业技术创新主体系统、技术创新对象系统、技术创新支持系统之间的协同作用。三者之间必须密切配合,协同工作,才能使企业技术创新系统处于最优化运行状态,从而获得最大的整体效益。企业技术创新系统协同内部影响因素包括企业技术创新能力、创新组织管理、创新资金投入、生产运作平台、企业文化、市场营销与人力资源。企业技术创新系统协同的外部影响因素主要有社会经济制度、市场环境、社会文化环境、竞争者四个方面。企业技术创新系统要素协同的内部动力主要是指企业内部在技术创新过程中的各种技术创新动力要素。企业家创新意识、企业技术创新能力、企业研发投入以及激励机制。企业技术创新系统要素协同外部动力主要包括市场动力机制、政府动力机制和科技动力机制三个方面。企业技术创新要素协同度评价的基本方法包括：因子分析法、综合指数法、序参量法。企业技术创新系统协同绩效评价指标体系包括创新管理、创新资金实力和研发投入、企业文化、企业的创新产出、外部环境要素。目前,我国企业虽然在创新能力上均有显著提高,但是总体还存在技术创新体系构建不甚完善、缺乏协同发展机制等问题,导致企业技术创新能力较弱、创新成果较少,进而降低综合国际竞争力。因此,我国需要借鉴具有较强技术创新竞争力企业的成功经验,从外部强化政府扶持力度、完善法律法规、实施总体创新调控、构建良好社会环境；从内部构建现代企业制度、完善企业技术创新激励机制、增强技术创新投入的力度、营造有利于技术创新企业文化等,确保企业技术创新系统健康协同发展。