人类社会进入21世纪以来,随着社会经济的进步和科学技术的高速发展,人类文明得到了空前的发展和繁荣,但是人与自然环境之间的矛盾日益突出,生态破坏、环境污染、生态失衡……,在这样的社会历史背景下,生态伦理就应运而生了。面对日益严重的生态问题,单单依靠生态伦理观念的作用是远远不够的,而传统的行政管理手段在当今社会发展的背景下也略显乏力。排污权交易制度是在充分考虑市场本身调节作用的基础上所诞生的一种新兴的治理污染的手段,运用排污权交易可以很好的解决市场主体、客体之间的责任,同时也能极大地调动排污主体治污的积极性。生态伦理以一种意识形态的作用在影响着人的行为,引导人们的行为方式。在排污权交易体系中,生态伦理的主体和客体都对生态环境有着极为重要的影响。排污权交易制度是一种物质形态,是生态伦理意识的物质表现。生态伦理对排污权交易制度实施的软控制不足具有补充作用。本文通过研究两者之间的关系,提出在生态伦理指导下的排污权交易的实施体系中,企业、政府、个人所应该承担的责任和享有的权利。同时,在排污权交易体系中,分析生态伦理的对象、主体、客体、基本原则,进而得出生态伦理在排污权交易中的指导作用。