基于深度学习的粗标记胃癌病理切片图像分割算法

来源 :湖南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:golf
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
癌症是人类难以攻克的顽疾,其中胃癌以其高发病率、高致死率高居我国癌症第二位,仅次于肺癌。自20世纪中后期起,研究人员就开始医学图像分割相关技术的研究,希望通过计算机辅助技术减轻病理学家的沉重负担,但是这些算法通常鲁棒性较差,过程复杂且无法提供语义信息。同时,高额的人工标注成本也限制着监督式深度学习在医学图像分割领域的应用。因此,将半监督的深度学习应用于胃癌诊断中,不仅可以挽救无数患者的生命,而且对于节约医疗资源成本,缓解医患矛盾也有重大意义。本文在分析深度学习在国内外医学图像识别研究与应用现状的基础上,对癌症病理切片的分割进行详细的研究,探讨并分析了各种方法的优缺点。本文通过将传统基于图块的图像分割与基于全卷积神经网络的图像语义分割相结合,使用半监督学习探索在粗标记数据集上的图像语义分割方法。同时,本文提出区域重叠预测算法,用于消除图块之间的误差,提升预测效果。为了进一步提升模型的泛化能力与性能,本文在网络模型的后端使用全连接的条件随机场进行后处理,通过计算网络输出的概率图与原图像中像素点之间的颜色纹理的特征之间的关系,为特征相近的像素分配相同的标签。本文还提出了一种迭代学习的学习机制,通过使用已有模型预测训练集并进行处理,反复再训练以提高模型的性能与精度,从而完成图像语义分割的任务。另外,本文针对目前现有的开源数据标注软件用户体验差,标注过程繁琐等缺点,开发编写了一套数据标注软件,以实现高效快捷的数据标注。本文通过训练基于图块的卷积神经网络,使用数字图像处理技术进行预处理,结合全连接条件随机场、区域重叠预测等算法进行后处理,以重复学习的学习机制进行效果优化与提升,结果完全达到预期的目标。在没有任何后续人工标注的情况下达到了 88.31的平均交叉联合度量(IOU),91.09%的平均精确度,并赢得了 2017中国大数据人工智能创新创业大赛的冠军。通过本文的研究,充分证明了在粗标记医学图像上进行半监督学习能够取得接近全监督学习的效果,这将极大的减少模型对于金标准数据集的依赖,节约成本,对于医学图像语义分割方法的发展具有重要意义。本文的主要贡献共有以下几点:1.本文提出重复学习的训练框架,使得网络在没有任何后续标记,不进行任何预训练的情况下,在粗标记的数据集上达到目前最好效果。2.本文结合基于图块与全卷积神经网络进行胃癌数字病理图像的分割任务。3.本文提出一种全新的基于区域重叠预测的算法进行后处理。4.以我们所知,本文是首篇阐述使用深度学习解决胃癌病理切片分割问题的文章。
其他文献
本文介绍了一种可用于交通标志识别的新方法——支持向量机(SVM)算法,并将SVM算法与BP算法在交通标志的粗、细分类中的识别效果进行了对比分析。用中国的116个和日本的23个交通标志标准图分别训练基于SVM算法和基于BP算法的智能分类器,并用中国标志的噪声图、扭曲图和531个日本交通标志实景图作为测试集。在粗分类中,虽然BP算法的识别率也能达到90%以上,但SVM算法的识别率几乎可达100%,二者
网络监测在现代基于IP的网络中具有越来越重要的作用.随着网络速度的增加,作为网络监测关键部分的报文捕获引擎暴露出了在性能上的不足.FPC是一个Linux下基于内核的高效报文
低功耗目前已成为嵌入式实时系统设计中非常重要的性能需求。动态电压调度DVS机制通过动态调整处理器电压进而有效降低系统功耗,正在逐渐得到广泛应用。抢占阈值调度策略实现
黄花胡椒(Piper flaviflorum)是胡椒科(Piperaceae)多年生木质藤本植物,为我国特有,目前主要分布于云南中南部至西南部,分布范围狭窄、资源量小。为找出生殖环节中的关键因素
本文的目的是阐明一种Mel频率倒谱参数特征的改进算法。该算法是通过线性预测的方法从语音信号中提取出残差相位,同时将残差相位与传统的MFCC相结合,并应用到语音识别系统中
本文在分析EDR和Crowds匿名技术的基础上提出了一个可扩展的假名通信协议C-EDR。C-EDR通过对接收者地址加密和随机转发取得了强匿名和高效率,减少了消息头部开销,提高了可扩展
面对21世纪经济发展,中国贸易影响力的加强,人才培养规格的提升,应用型本科院校的商务英语专业课程教学亟待转型,本文从广东省中小外贸企业用人单位的问卷调查结果分析,以生
目的观察补心软脉颗粒含药血清对AngⅡ诱导HUVEC细胞所致氧化损伤的相关指标SOD、NADPH、MDA、p40phox、p47phox、p67phox的影响。方法大鼠被随机分为正常组、缬沙坦组、补心
本文对一种新型的视频点播系统P2Cast视频点播系统的关键技术进行了研究,针对段阈值在系统的可扩展性方面以及视频服务质量方面所起的重要作用,结合补丁流算法和客户节点的请求
似乎周围同学的专业都可以用简单的字眼来描述.比如会计、英语,又或者金融、管理。一直觉得很难用一个词或者一句话来描述我的专业,而一句“我是一名数字媒体艺术(网络多媒体方向