本文使用RFLP技术分析了南海海域石斑鱼属野生蜂巢石斑鱼、鲑点石斑鱼、青石斑鱼、赤点石斑鱼和七带石斑鱼的种内和种间遗传多样性、种间亲缘关系和系统分化，构建了这五种鱼的酶切物理图谱，并建立了识别它们的分子遗传标记。 用差速离心法从蜂巢石斑鱼、鲑点石斑鱼、青石斑鱼、赤点石斑鱼和七带石斑鱼五种鱼的新鲜肝组织中提取线粒体DNA。纯化后的mtDNA用识别5、6碱基序列的17种限制性内切酶，即BamH I，Bgl I，Bgl II，Dra I，EcoR I，EcoR V，Hind III， Kpn I，Mlu I，Pst I，Pvu II，Sal I，Sca I，Sma I，Sty I，Xba I和Xho I进行单酶切和双酶切，用凝胶成像分析系统检测。根据各酶切片段的长度，测算出蜂巢石斑鱼、鲑点石斑鱼、青石斑鱼、赤点石斑鱼和七带石斑鱼的mtDNA分子大小分别为18.52±0.21kb、18.44±0.21 kb、18.56±0.18 kb、18.57±0.19 kb和18.36±0.11 kb。 采用基因多样性指数（h）、酶切类型间平均遗传距离（P）和核苷酸多样性指数（π）等指标对群体内的遗传多样性进行了描述。在蜂巢石斑鱼、鲑点石斑鱼、青石斑鱼、赤点石斑鱼和七带石斑鱼群体内分别检出了8种、5种、8种、5种和2种酶切类型，基因多样性指数（h）分别为：0.8943、0.6186、0.9242、0.6927和0.1820；酶切类型间平均遗传距离（P）分别为：0.62±0.31％、0.64±0.37％、1.12±0.55％、0.72±0.42％和0.45％；核苷酸多样性指数（π）分别为：0.22％、0.13％、0.46％、0.17％和0.04％。这些结果说明湛江沿海野生石斑鱼的遗传变异水平较高，遗传多样性比较丰富。 蜂巢石斑鱼、鲑点石斑鱼、青石斑鱼、赤点石斑鱼和七带石斑鱼种间研究的结果是：种间净遗传距离（Pnet）分别为：0.0694（蜂巢-鲑点）、0.1337（蜂巢-青石斑）、0.1090（蜂巢-赤点）、0.1286（蜂巢-七带）、0.1590（鲑点-青石斑）、0.0825（鲑点-赤点）、0.1153（鲑点-七带）、0.1131（青石斑-赤点）、0.0724（青石斑-七带）和0.1336（赤点-七带）。用NJ法和UPGMA法对这五种石斑鱼进行聚类分析，两种方法得出的分子聚类图具有相同的拓扑结构。从结果可知，蜂巢石斑鱼和鲑点石斑鱼首先聚在一起，然后和赤点石斑鱼聚类，最后再与青石斑鱼和七带石斑鱼相聚。 通过单、双酶切分析，分别构建了蜂巢石斑鱼10种酶共20个酶切位点、鲑点石斑鱼9种酶共17个酶切位点、青石斑鱼8种酶共16个酶切位点、赤点石斑鱼7种酶共12个酶切位点和七带石斑鱼8种酶共13个酶切位点的酶切物理图谱。 BglⅡ和XhoⅠ两种内切酶的酶切带型可作为鉴别这五种石斑鱼的分子遗传标记。 此外，本文还使用PCR-SSCP技术对这五种石斑鱼进行了初步分析。使用通用引物L14841和H15149在这五种石斑鱼的总DNA中均扩增出mtDNA Cyt-b基因编码区中大小约为370bp左右的一段DNA序列。 在蜂巢石斑鱼、鲑点石斑鱼、青石斑鱼、赤点石斑鱼和七带石斑鱼群体内分别检出了2种、4种、3种、2种和2种Cyt-b基因型。以A型为最常见。