近年来，南麂岛海域赤潮灾害频繁发生，贝毒中毒事件时有出现，严重制约南麂岛水产养殖业和旅游业的发展并威胁人民群众身体健康。鉴于目前南麂岛贝类毒素多为零星短暂的调查，本研究于2006年4月至2007年3月在南麂岛的马祖岙、大沙岙等6个海域逐月采集野生或养殖的6类经济贝类，60份样品进行PSP和DSP的检测，旨在通过连续广泛的跟踪调查检测，获取PSP和DSP在该海域分布的时空特征和种间差异。主要研究结果如下：①PSP含量普遍较低，检出率为11.7％，检出值均低于我国目前暂定的警戒值。②PSP的季节变化十分明显，主要出现在春季和冬季。③PSP主要分布在大沙岙、马祖岙、火焜岙三个区域，整体分布特征较为明显，呈现由南向北、自西向东递减的趋势。④易于积累PSP的主要贝类为养殖的虾夷扇贝、紫贻贝以及野生的牡蛎。⑤PSP主要成分为GTX1、GTX4和GTX5(B1)。⑥DSP检出率和超标率都较高，分别达到了63.3％和56.7％。⑦DSP检出率和超标率基本呈现逐季递减的特点。⑧DSP地域分布范围广，呈现由南向北递增的趋势。⑨易于积累DSP的主要贝种为养殖的虾夷扇贝和紫贻贝，野生的牡蛎、条纹隔贻贝和厚壳贻贝。人工养殖的贝类较野生贝类吸收积累DSP的能力更强。在贝毒调查研究的基础上，设计南麂岛贝毒监测方案，确定了监测贝种、采样站位、采样频率、检测方法、毒素警戒值和防控反应机制等，以期为相关部门完善和强化贝类监督和管理工作提供科学依据和理论参考，从而保障贝类的食用安全和近岸养殖业的健康发展。