【摘 要】
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地方特色猪种的选育是中国畜禽种业发展的重要组成部分。东辽黑猪是吉林省知名的特色品种,具有适应性强、抗寒冷、耐粗饲等优良特性。本研究开展了东辽黑猪群体的遗传结构与遗传多样性分析,建立分子系谱,并对东辽黑猪产仔数性状进行基因组选择。研究结果有利于东辽黑猪系统选育和品种标准化,为新品种选育提供研究基础和核心育种群。对937头东辽黑猪进行体型外貌评分,筛选出符合选育标准的765头（42头公猪,723头母猪
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地方特色猪种的选育是中国畜禽种业发展的重要组成部分。东辽黑猪是吉林省知名的特色品种,具有适应性强、抗寒冷、耐粗饲等优良特性。本研究开展了东辽黑猪群体的遗传结构与遗传多样性分析,建立分子系谱,并对东辽黑猪产仔数性状进行基因组选择。研究结果有利于东辽黑猪系统选育和品种标准化,为新品种选育提供研究基础和核心育种群。对937头东辽黑猪进行体型外貌评分,筛选出符合选育标准的765头（42头公猪,723头母猪）,采集耳组织样,提取DNA,利用“中芯一号”SNP 50K芯片进行SNP基因分型。将东辽黑猪公猪的芯片数据与13个其它猪种（6个中国猪种、5个西方猪种、欧洲野猪、亚洲野猪）的重测序数据,共410个样本进行合并,利用Plink进行质量控制,利用GCTA、ADMIXTURE、MEGA等软件进行了主成分、血统混杂、系统进化树以及遗传多样性分析。利用765头东辽黑猪芯片数据计算个体间遗传距离,构建分子系谱,并进行家系划分。基于东辽黑猪产仔数性状数据,估计群体遗传参数和育种值,选留核心群母猪。研究结果如下:1.主成分、血统混杂、系统进化树分析结果表明,东辽黑猪与东北民猪血统最相近,在早期有巴克夏血统混入,近期有杜洛克血统混入。遗传多样性结果分析表明,东辽黑猪遗传多样性丰富,其群体的观测杂合度值和标记多态性比例值分别为0.377和0.981,有利于特色优势性状的基因挖掘和提纯选育工作。2.计算得到东辽黑猪个体间的遗传距离（1-IBS）,大多数个体间具有中等亲缘关系,群体内平均遗传距离为0.28。利用遗传距离构建分子系谱,将群体划分为22个家系,并为猪场后续育种工作制定了相应的选配方案。3.利用重复力模型估计了东辽黑猪群体产仔数性状的遗传参数,总产仔数和产活仔数性状遗传力的估计值分别为0.108和0.075,重复力分别为0.208,0.156。总产仔数性状的估计育种值处于-1.584～1.307之间,产活仔数性状的估计育种值处于-1.086～0.898之间,根据育种值高低筛选组建了育种核心群。结论:基因组数据分析表明东辽黑猪与东北民猪血统最相近,在早期有巴克夏血统混入,近期有杜洛克血统混入,群体内具有丰富的遗传多样性。通过构建分子系谱,将东辽黑猪群体分为22个家系,制定了选配方案。东辽黑猪群体总产仔数和产活仔数遗传力估计值较低,根据育种值高低筛选组建了育种核心群。
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