目的：本研究旨在了解乡镇卫生院实施绩效管理的情况和基本公共卫生服务绩效考核现状,发现取得成效和存在的问题,致力于探寻影响乡镇卫生院基本公共卫生服务绩效考核的因素,进而为完善基层医疗卫生机构的绩效管理提供参考建议,以进一步提高重庆市基本公共卫生服务水平。方法：本研究主要方法包括：(1)文献研究法； (2)现场调查,通过问卷调查、深度访谈、专题小组讨论取得本研究所需的定性和定量资料；(3)统计学方法：主要运用统计描述、TOPSIS法和回归分析法。结果：1.通过调查发现基本公共卫生服务绩效存在以下问题： (1)缺乏统一的考核指标体系作为指导。 (2)绩效考核流于形式,缺乏监管,考核结果运用单一。(3)绩效工资总量限制太死,激励措施不足。(4)信息化水平低。(5)人力资源结构不合理,专职从事基本公共卫生服务的卫生技术人员数少。2.TOPSIS法对乡镇卫生院基本公共卫生服务总体绩效评价结果显示,最优得分0.7357,最劣得分0.0935,乡镇卫生院基本公共卫生服务绩效两极化明显,其中A区总体情况最好,E县情况最差。3.对比分析和单因素分析法发现绩效考核机制、基本公共卫生绩效考核指标体系、人力资源结构、基本公共卫生服务补助金额和绩效主管领导的能力对绩效有影响,其中绩效考核机制中的绩效考核方案设置、绩效沟通、绩效监督和绩效结果反馈和运用环节尤为重要。结论建议：建立健全绩效管理机制,保障绩效各个环节有序开展,加强绩效沟通,完善基本公共卫生服务绩效考核监管办法,保证考核结果的真实性和运用多元；建立健全有利于基本公共卫生服务开展的指标考核体系,确保绩效考核的指标设置和赋值的科学化,侧重慢病健康管理的考核力度；规范绩效资金管理,充分发挥激励措施；优化乡镇卫生院人力资源结构,提升院长领导能力；鼓励居民参与,提升满意度；加快乡镇卫生院信息化建设。