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前列腺癌是男性泌尿生殖系统最常见的恶性肿瘤之一,我国相较于欧美发达国家,是前列腺癌低发区,但是近年来中国男性的前列腺癌发病率呈明显上升趋势,已经成为了危害我国中老年男性的重要疾病之一。前列腺癌是一种由多基因多水平共同作用的复杂疾病。传统生物学研究无法在整体上揭示DNA、RNA和蛋白质组成的生物分子复杂网络在前列腺癌发生进展中的作用。近年来,海量高通量数据的产生和权重基因共表达网络等生物网络分析法的应用提供了一个从宏观而全面的角度解析疾病中复杂相互作用网络的解决方案。我们分别以权重基因共表达网络分析方法构建发生风险相关网络与进展风险相关网络,共得到七个发生风险模块和一个进展风险模块。其中,七个发生风险模块参与的通路和生物学过程主要是肿瘤血管生成、细胞信号转导、细胞周期与细胞修复、m RNA的加工处理、药物代谢、DNA修复、蛋白质的修饰加工、消化腺分泌调节。进展风险模块主要参与了细胞周期、细胞分裂和细胞修复过程。对比其差异表达基因的富集结果,模块富集到的通路和生物学过程更具体细致,有助于深入了解不同表达模式的基因在癌症中的具体作用。在七个发生风险模块中与癌症发生风险相关程度最高(cor=-0.47)的模块富集于c AMP和钙通道等信号通路,提示这些通路的紊乱与前列腺癌的发生有密切关系。枢纽基因中有较多lnc RNA排名靠前,显示lnc RNA在其中起了重要作用。其中模块身份值(MM)较高的枢纽基因RBMS3,枢纽lnc RNA ADAMTS9-AS2已经被文献证实为抑癌基因,表明枢纽基因可能在前列腺癌发生过程中起到重要调控作用。通过构建前列腺癌进展相关权重基因网络,联系临床进展特征,我们发现与肿瘤侵袭呈现较强相关的模块,与发生风险模块其中之一重叠性很高,证明其富集的细胞周期与细胞分裂等通路的失衡贯穿了前列腺癌的发生发展过程,其枢纽基因CENPE、CENPF、NUSAP1以及RACGAP1等已被广泛报道与前列腺侵袭进展以及癌症恶性程度密切相关。本研究表明,基于网络的权重共表达分析方法联合临床样本信息,能够为探索前列腺癌发生发展的分子机制,发现新的的分子标记物和潜在治疗靶点提供有力的理论依据。