2007年春夏之交,太湖大面积的蓝藻水华及随之而来的水质恶化和水源地污染,已使湖库的富营养化问题得到了社会各界前所未有的关注。湖库富营养化和水华灾变严重影响着湖库系统的生态安全,进而危及到人类水源地安全,威胁着区域经济社会的可持续发展。因此,系统而科学地评估湖库系统的生态安全状况势必成为保障湖库区域经济社会可持续发展的重要议题。目前,国内外对湖库生态安全评估的研究相当匮乏,其评估指标体系、评估标准及等级划分和评估方法基本沿用区域或流域生态安全评估的方法。如何准确而系统性地定量评估湖库的生态安全,迄今在理论和方法论上尚未有突破性和令人信服的研究成果。本文在剖析坊间有关区（流）域生态安全和湖库生态安全评估研究进展及弊端的基础上,以可持续发展基本理论、系统科学和生态学基本原理为指导,立足于湖库生态系统这一主体,在对人类活动压力、湖库生态健康和湖库服务功能进行评估的基础上,提出了人类胁迫指数（F₁）、需求服务指数（F₂）和湖库生态安全指数（F₃）及适用于水体生态安全评估的广义对比加权法;通过严谨的理论推导与模型构建得出了湖库生态安全综合评估的指标和方法体系,并以巢湖为例进行了验证评估。研究结论表明,该套评估指数和模型方法构建符合系统科学及生态学基本原理,能够较为科学地评判湖库系统的生态安全及其对区（流）域可持续发展的影响,且为我国其他湖库的生态安全评估及横向比较研究提供了科学合理、简便易行的技术支持。