东北林蛙MHC基因的多态性及其遗传进化

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主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)是脊椎动物所具有的、能够编码MHC分子的一类多基因家族,与动物体的抗病性、性选择和遗传进化密切相关,其编码产物能够识别外源性抗原和内源性抗原,并呈递给T细胞,从而引发机体的免疫应答。因此,MHC基因是研究脊椎动物适应性进化和物种保护的最佳候选基因和目标基因。东北林蛙(Rana dybowskii)是一种对寒冷气候具有较强适应能力的无尾两栖类,主要分布于我国的东北地区,野生资源曾经十分丰富,但由于环境的改变和人类的过度利用,东北林蛙的种群数量大量减少,已被列为易危物种。为了更系统的了解东北林蛙MHC基因的多态性、进化机制,本研究选择了黑龙江省伊春市、尚志市和吉林省白山市3个种群的东北林蛙,利用分子克隆和DNA测序的方法对MHC基因进行遗传进化和多态性分析,主要研究结果如下:(1)获得500 bp左右的MHC?类α1+α2肽结合区片段(包括部分外显子2和全部外显子3序列),共12条等位基因,核苷酸变异位点为15.2%,其中尚志种群有5条等位基因,至少有3个MHC?类基因座,多态性最高;(2)获得250 bp左右的MHC??类基因exon2片段,共7条等位基因,核苷酸变异位点为19.6%,其中伊春种群有3条等位基因,至少有2个MHC??类基因座,多态性最高;(3)获得的MHC?类α1+α2肽结合区和MHC??类基因exon2区域氨基酸距离均大于核苷酸距离,非同义替换率也都大于同义替换率,暗示其经历过正选择;(4)MHC?类基因检测到26个选择位点,其中有2个选择位点位于假定抗原结合位点处;MHC??类基因检测到22个选择位点,其中有4个选择位点位于假定抗原结合位点处,推测东北林蛙MHC多态性的维持与病原体诱导相关;(5)MHC?类基因exon3和MHC??类基因exon2内含子检测没有发现东北林蛙MHC基因存在重组的现象,也没有显示出跨物种多态性。上述结果表明,东北林蛙MHC?类基因和MHC??类基因均具有丰富的多态性变化,在进化过程中经历了基因突变、复制等作用,从而为东北林蛙的物种保护研究提供了较好的理论基础。
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