知识产权作为一种特殊的民事权利,兼有公权与私权的属性。不仅要保护权利人的民事权益,而且还要维护社会的公共利益。因此,与其他的民事权利相比,专利权的保护除了采取司法保护的途径以外,还可以由管理专利工作的部门通过行政管理的手段进行保护。我国专利权实行的是行政保护与司法保护双轨制模式,是符合我国社会主义国情特色的,同时也符合有关国际公约的规定。该种模式在维护我国市场经济秩序,制止侵权行为,保护专利权人的合法权益方面发挥着重要的作用。一般情况下,行政保护与司法保护并没有冲突可言,但是在知识产权保护领域内,由于知识产权本身的权利属性,特别是相关权利的产生来自不同的行政机关的授予,对于同一个专利侵权事实,专利权人可以分别选择行政保护或是司法保护两个不同的途径予以解决,这就使得专利行政保护与司法保护之间产生紧密联系的同时又产生了冲突。随着越来越多复杂的专利案件,专利行政保护与司法保护双轨制保护模式还存在一些需要解决的法律问题。因此,深入分析我国专利权行政保护与司法保护的不足及之间存在的问题,进一步探讨如何完善我国专利双轨制保护模式是一个具有理论研究价值和现实社会意义的课题。通过对我国专利行政保护与司法保护的论述,提出了目前我国专利双轨制保护模式的不足主要体现在专利确权问题、两者之间的冲突与不协调等问题。这些问题一方面造成了有限的行政资源和司法资源的浪费,另一方面也不利于实现社会的公平正义。我们务必从我国国情出发,分析研究现阶段专利双轨制保护模式的不足,同时借鉴国外的专利保护制度的先进经验,采取一些具体的措施完善双轨制保护模式,如逐步完善相关立法、建立专利行政保护与司法保护机制的协调以及构建网上衔接和信息共享平台等措施,并在此基础上实现专利行政保护与司法保护资源的有效整合,实现更大更优的效力。