咽侧体抑制素是无脊椎动物中最大的神经肽家族之一，在昆虫中它不仅可以抑制保幼激素的合成与释放，还可以通过调节肌肉的收缩影响其它生理过程。然而在除昆虫以外的其它任何物种中，均没有编码咽侧体抑制素基因的报道，更没有其基因表达时空特征以及相关调控因子的研究。 本研究以具有重要经济价值的淡水虾类—罗氏沼虾(Macrobrachimrosenbergii)作为研究对象，从其中枢神经系统的cDNA文库中分别克隆到罗氏沼虾咽侧体抑制素基因(命名为Macro-ASTA)及其内源性天然反义基因(命名为asMacro-ASTA)。Macro-ASTA全长为2,855bp，编码一个由701个氨基酸残基组成的咽侧体抑制素前体多肽。如果所有的碱性蛋白酶切位点被识别剪切，那么这个前体多肽最少可以形成35个，29种不同类型的咽侧体抑制素。asMacro-ASTA全长为2,182bp，包含的最大开放阅读框仅由159bp组成。Blast分析发现没有其它已知的基因或蛋白与asMacro-ASTA具有同源性。但是，在其序列内部(882bp到1,725bp)存在一段与Macro-ASTA基因3末端完全反向互补的序列。这是首次在甲壳动物中发现编码咽侧体抑制素的基因，同时，也是在所有已发现的咽侧体抑制素基因中首次检测到它们存在天然反义基因。 另外，运用半定量RT-PCR和Southernblottinganalysis等分子生物学手段分析了Macro-ASTA在罗氏沼虾体内的分布情况和发育表达特征，以及在基因组上的拷贝数。结果表明：Macro-ASTA在神经组织如脑、胸部神经节、腹部神经节和内分泌组织如肠中表达，而在其它组织如心脏、腮、卵巢、肝脏或肌肉组织中均不表达；雌性罗氏沼虾从未成熟向成熟阶段发育的过程中，不论是在胸部神经节还是在脑组织中Macro-ASTA的表达量都呈现增加趋势，但是在蜕皮后一天表达量下降，而且在脑组织中，这种增加与下降的趋势更加明显；在雄性罗氏沼虾的附肢掌节从白色向黄色转变的过程中，Macro-ASTA的表达量在胸部神经节中呈上升趋势，在脑组织中呈下降趋势；当雄虾附肢掌节变蓝时，Macro-ASTA的表达量在胸部神经节中迅速下降，在脑组织中基本无表达；Macro-ASTA在罗氏沼虾的基因组中以单拷贝形式存在。 最后，为了证明正义基因Macro-ASTA与其天然反义基因asMacro-ASTA之间是否存在相互作用，我们运用Northernblottinganalysis以及依赖于核糖核酸酶保护分析的RT-PCR等方法证明：asMacro-ASTA在罗氏沼虾的胸部神经节中有表达，而Macro-ASTA也在此组织中表达；在胸部神经节中，Macro-ASTA与asMacro-ASTA的转录本之间在互补区域形成了RNA-RNA二聚体。这些结果说明反义基因可能对咽侧体抑制素基因的表达有着重要的调控作用。 总之，这是第一次在甲壳动物中分离到编码咽侧体抑制素的基因，并研究了其组织分布与表达特征。同时本研究也是第一次发现咽侧体抑制素基因存在天然反义基因，更为重要的是，本研究还发现正义基因与反义基因的转录本之间形成了双链RNA结构，说明二者之间可能存在基因的表达调控。