牙鲆vasa基因的克隆、表达分析及其启动子调控的GFP报告载体构建

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原始生殖细胞(Primordial germ cells,PGCs)是有性生殖动物生殖细胞的祖细胞,在早期胚胎中形成后迁移到性腺原基,并最终产生卵和精子。Vasa属于ATP依赖的RNA解旋酶中DEAD-box家族。自发现以来,vasa被认为是生殖细胞最可信的分子标记之一,在生殖系的起源、发育以及配子形成过程中发挥重要作用。牙鲆(Paralichthys olivaceus)是我国最重要的海水经济鱼类之一,对其生殖发育以及优良种质资源保存的研究具有重要意义。本文克隆了牙鲆Po-vasa的全长序列,并进行了序列特征分析和表达分析。通过染色体步移技术获得Po-vasa启动子序列,并构建了启动子调控的绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)报告载体pvasa-EGFP,为将来追踪和分离牙鲆PGCs奠定基础。牙鲆Po-vasa cDNA全长2461bp,其中ORF1941bp,编码646个氨基酸。5UTR为175bp,3UTR为345bp。预测的氨基酸序列具有DEAD-box家族蛋白所共有的9个保守结构域以及普遍存在于许多物种Vasa蛋白N末端的RG和RGG重复序列。结合染色体步移技术,最终得到牙鲆基因组中11443bp的片段。该片段包括了6927bp的牙鲆vasa基因全长,3333bp的5侧翼区和1183bp的3侧翼区。Po-vasa基因全长共23个外显子和22个内含子,起始密码子位于外显子II中。荧光定量PCR分析显示,在十种不同组织中Po-vasa的表达仅限于性腺,其中卵巢内的表达水平显著高于精巢内的表达水平;胚胎发育早期Po-vasa为母源性表达,原肠胚期之前表达量高且较稳定,在原肠期表达量骤降,低水平表达持续到孵化后1天。通过对Po-vasa的PCR扩增及测序,发现存在10种选择性剪接产生的不同的5部分序列,而3部分未见差异。因此推测牙鲆vasa基因至少存在10种选择性剪接异构体,编号A~J。A为本实验最初克隆到的也是最主要的一种转录本。异构体J由于缺失了8个碱基导致了移码突变,其他异构体则均包含DEAD家族的9个保守结构域。对异构体B~J进行相对定量分析结果表明,不同异构体在性腺中的表达量不同,F表达量最高;同种异构体在精巢和卵巢的表达量也存在差异,如E和F。这些异构体在早期胚胎发育时期的表达模式也不尽相同。因此,不同异构体可能行使着不同的功能。利用多种在线分析软件对Po-vasa3.3kb的启动子区域进行生物信息学预测分析。在转录起始点TSS上游31bp处有1个典型的TATA box。启动子区存在GATA-1、C/EBP、AP-1、SP-1、Oct-1、MZF1、c-Myc、SRY、Sox-5、AML-1a、HNF-3B等多个转录因子结合位点及多个糖皮质激素受体GR的结合位点,推测其可能对Po-vasa的调控起到关键作用。PCR扩增Po-vasa的5和3调控序列,与增强型绿色色荧光蛋白(EGFP)基因连入载体,构建牙鲆Po-vasa启动子调控的GFP报告载体。将来经过进一步研究分析启动子效率和绿色荧光蛋白在PGCs中的特异表达,可以为PGCs起源和迁移的研究以及分离PGCs提供基础。
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