本文以16个富士系苹果的芽变初选优系及其对照品种富士、长富2、长富6为试材，进行了花粉粒形态性状、气孔大小密度等细胞学方面的研究，并应用RAPD和ISSR技术进行了分子生物学鉴定，结果如下：1.无论是花粉粒的大小、形态还是气孔的大小、密度，芽变初选优系与其对照之间均无显著差异，所有试材的花粉粒的形状均为圆三角形。2.建立了苹果RAPD扩增反应体系：25μl反应液中，10×Buffer2.5μlMgCl₂2.0mM，dNTP0.19mM，primer 0.24μM，DNA30ng，Taq DNA polymerase1U。3.筛选了300个随机引物，其中S1147和S1189鉴别出丰6芽变初选优系；S1125、S1141、S1138鉴定出D₁芽变初选优系；S1073、S1039、S1064、S1056鉴别出D₂芽变初选优系；S1124、S1127、S1140、S1179、S1181鉴别出了D₃芽变初选优系；S1146、S1302、S1090、S1291鉴定出了D₄芽变初选优系。4.建立了苹果ISSR反应体系：25μl反应液中，10×Buffer2.5μL，MgCl₂1.5mM，dNTP0.20mM，primer0.4μM，DNA30ng，Taq DNA polymerase1U。5.构建了富士、长富2、长富6、红星、新世纪、美国8号6个品种的ISSR指纹图谱，其中IS061构建了富士、长富2、长富6三个品种的指纹图谱，IS026成功地构建了富士、红星、新世纪、美国8号的指纹图谱。6.运用ISSR技术鉴定出了9个富士芽变初选优系，其中有5个芽变初选优系应用RAPD技术无法鉴定。