不同核基因背景下超级复合体组成形式的研究

来源 :温州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liu_kun
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研究背景:  线粒体呼吸链的多个复合体可以进一步组装成更大的超级复合体,但是只有超级复合体Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn可以直接从NADH传递电子到氧。由于线粒体是为机体产生能量供应极为重要的细胞器,因此线粒体呼吸链超级复合体在人类疾病中发挥了重要的作用,比如癌症与衰老等。近年来,有报道称在小鼠中超级复合体Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn的组成形式是否存在主要与小鼠核基因背景相关。然而,我们的研究发现超级复合体Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn的组成形式在不同人与小鼠的细胞系中都存在。我们将靠近CⅤ二聚体最近的超级复合体定义为LSC,以往的文献报道认为LSC仅由Ⅰn+Ⅲn组成,我们通过非变性胶分析,发现在部分人与小鼠的细胞系中LSC由Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn组成。并且我们通过确认LSC中cytc的存在辅助验证了LSC具有完整的传递电子的功能,进而说明LSC可能是一个可以行使呼吸功能的实体。此外,我们发现一个由于LSC(Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn)缺陷而引起功能缺陷的线粒体复合体Ⅰ编码基因ND1上m.3697G>A突变导致的Leigh综合征的病人的呼吸功能下降以及ATP生成减少。通过本课题的研究,我们验证了LSC(Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn)可能是有功能的实体,并且是因其缺陷会导致疾病发生的一个重要因素。  目的:  1、通过研究发现,不同细胞系的超级复合体组成是有差异的,由于以往的报道中多数细胞系的LSC仅由Ⅰn+Ⅲn组成,我们选定多种小鼠以及人的细胞系进行验证LSC的组成。  2、筛选线粒体复合体Ⅰ相关的核基因(NDUFS3)以及线粒体基因(ND1、ND6)突变的线粒体代谢疾病的患者,分别构建永生化细胞系和融合细胞系。研究不同核基因背景以及线粒体背景的细胞模型LSC的组成差异。  3、通过2D BN/SDS-PAGE验证LSC中cyt c的存在以及用氯霉素(CAP)处理监测其动态变化过程(组装与去组装),验证LSC在线粒体呼吸链超级复合体中的重要功能。  4、通过对构建的高低异质率细胞模型(ND1: m.3697G>A)检测其线粒体功能差异性,揭示线粒体遗传学背景在Leigh氏综合征中的发生发展机制及其临床诊断应用价值。  方法:  1、通过BN-PAGE技术检测小鼠的3A19(C57BL/6J鼠源)细胞系的超级复合体的组成形式,并从C57BL/6J小鼠肝脏组织提取线粒体蛋白,进行CⅠ和CⅣ的IGA验证了超级复合体的活性。  2、通过BN-PAGE技术检测了小鼠的HIB1B、A9、3T3-L1和C2C12细胞系,人的Hela、MDA-MB-231以及143B细胞系的超级复合体的组成形式。  3、查阅文献,确定本课题所用细胞系的来源。  4、通过BN/SDS-PAGE技术在143B及HIB1B细胞系中验证LSC的组成差异。  5、构建三个正常人以及核基因(NDUFS3)突变家系的永生化细胞系;收集并抽取患者外周血,提取其淋巴细胞构建永生化细胞系。通过BN-PAGE技术检测构建的永生化细胞系的超级复合体的组成形式。  6、通过BN/SDS-PAGE验证LSC中cyt c的存在,进一步确认LSC是否存在完整的传递电子的功能。  7、通过BN-PAGE技术,研究加入CAP培养HIB1B与C2C12细胞系后,LSC的组装与去组装动力学。其中HIB1B细胞系的LSC由Ⅰn+Ⅲn组成,C2C12细胞系的LSC由Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn组成。  8、构建线粒体基因(ND1) m.3697G>A突变的线粒体代谢疾病(Leigh Syndrome)的家系的融合细胞模型,收集并抽取患者外周血,提取血小板,用来构建融合细胞模型。通过酶切鉴定细胞克隆异质率,挑选高低异质率克隆各一个,分别为L、H细胞系,并用线粒体通用24对引物PCR扩增mtDNA全序,通过全序分析验证两个细胞克隆。  9、对3697位点进行保守性分析;对m.3697G>A家系抽血提取DNA,PCR后进行测序分析。  10、通过BN-PAGE技术检测L、H细胞系的复合体Ⅰ的胶内酶活性,五个单一复合体总量的变化,以及CⅠ、CⅢ、CⅣ相关的超级复合体的组装形式。以及SDS-PAGE检测五个复合体亚基的变化。并通过BN/SDS-PAGE技术再次确认LSC在两个细胞克隆中的组成差异。  11、通过BN-PAGE技术,研究加入CAP培养L、H细胞系后LSC的组装与去组装动力学。  12、构建线粒体基因(ND6)m.14487T>C突变的线粒体代谢疾病(Leigh Syndrome)的家系的融合细胞模型,收集并抽取患者外周血,提取血小板,用来构建融合细胞模型;挑选高低异质率克隆各一个。通过BN-PAGE技术检测高低异质率克隆的超级复合体的组成形式。与m.3697G>A的超级复合体形式进行比较。  13、将L、H细胞系培养至最佳状态后,检测两者的线粒体功能,分析两者的线粒体功能差异性。  1)应用Clark氧电极检测L、H细胞系氧耗量。  2)应用TMRM荧光染料检测L、H细胞系膜电位水平。  3)应用ATP检测试剂盒检测L、H细胞系产生ATP的水平。  4)应用乳酸检测试剂盒检测L、H细胞系的乳酸产生量。  5)应用ROS检测试剂盒检测L、H细胞系ROS的产生水平。  14、统计学分析:应用SPSS16.0软件分析L、H细胞系之间复合体表达量和线粒体功能的差异。  结果:  1、通过BN-PAGE技术检测了小鼠及人的多个细胞系的超级复合体的组成形式。LSC有两种形式,3A19、HIB1B、A9以及Hela细胞系中LSC仅由Ⅰn+Ⅲn组成;3T3-L1、C2C12、MDA-MB-231以及143B细胞系中LSC由Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn组成。  2、查阅文献,确定本课题所用细胞系的来源。3A19细胞系源自C3H非整倍体小鼠;HIB1B细胞系源自C57BL小鼠;A9细胞系源自Swiss Webster小鼠;3T3-L1细胞系源自Swiss albino小鼠;C2C12细胞系源自C3H整倍体小鼠;Hela细胞系源自一位美国妇女海莉耶塔·拉克斯(Henrietta Lacks)的子宫颈癌细胞;MDA-MB-231细胞系源自高加索人乳腺癌细胞;143细胞系源自高加索入骨肉瘤细胞。  3、通过BN/SDS-PAGE技术在143B及HIB1B细胞系中验证确认了LSC的组成差异与BN-PAGE一致,即143B细胞系LSC由Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn组成;HIB1B细胞系LSC由Ⅰn+Ⅲn组成。  4、通过BN-PAGE技术检测三个正常人构建的永生细胞系的LSC由Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn组成;在NDUFS3突变家系的永生化细胞系中可以发现与正常对照比较,LSC的含量下降了。  5、通过BN/SDS-PAGE技术检测LSC(Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn)中是否存在cyt c,发现Hela细胞系中仅可以检测到CⅠ和CⅢ,然而143B细胞系中不但可以检测到CⅠ和CⅢ,还可以检测到CⅣ和cyt c。证明了LSC(Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn)的确是有完整的呼吸功能的实体。  6、通过使用不影响mtDNA拷贝数,但是可逆抑制线粒体蛋白翻译的药物CAP处理细胞。首先研究组装动力学,通过结果可得,移除CAP4h开始LSC就开始进行组装,通过灰度分析计算可得,在4-48h时间段里,检测CⅠ相关的超级复合体,HIB1B细胞系的LSC(Ⅰn+Ⅲn)增加了32倍;C2C12细胞系的LSC(Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn)增加了25倍。CⅢ相关的超级复合体得到一致的趋势,可得C2C12细胞系的LSC(Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn)组装相对较慢。  7、通过研究去组装动力学,分析结果可得,在0-24h的时间段里,检测CⅠ相关的超级复合体,HIB1B细胞系的LSC(Ⅰn+Ⅲn)下降了71.18%; C2C12细胞系的LSC(Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn)下降了36.07%。CⅢ相关的超级复合体得到一致的趋势,可得C2C12细胞系的LSC(Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn)去组装相对较慢。  8、通过在多个物种中对3697位点进行保守性分析,发现该位点十分保守,一旦该位点发生突变,可能会对人体产生极大危害。  9、通过对m.3697G>A家系,对照(母亲)及患者(儿子)进行测序分析,一代测序结果显示对照无突变或突变极低,二代测序显示该患者为100%突变。  10、通过PCR-RFLP对m.3697G>A家系挑出的细胞克隆进行鉴定,最后筛选到异质率为0%的细胞克隆L以及100%的细胞克隆H来进行后面的研究。  11、通过对L、H细胞系的mtDNA测全序,发现除3697位点G>A突变外,无其他突变。  12、通过胶内酶活性结果可得H细胞系的活性相对于L细胞系下降了约30%; CⅠ的含量下降了约35%,CⅡ、CⅢ、CⅣ、CⅤ的含量没有差异。所以m.3697G>A突变仅仅导致了CⅠ的缺陷。  13、通过SDS-PAGE分析可得L、H两个细胞系的五个复合体亚基水平没有差异。所以,并不是由于复合体亚基水平下降而导致CⅠ的表达下降。  14、通过BN-PAGE分析可得两个细胞克隆超级复合体亚基除了LSC有差异,P<0.05,其他超级复合体没有差异。所以,m.3697G>A的致病可能是由于LSC的组成差异引起的。  15、通过BN/SDS-PAGE研究进一步确认了L、H两个细胞系LSC的差异,L细胞系的LSC中的CⅣ含量明显高于H。  16、通过对L、H细胞系加药CAP研究其组装动力学,可得L细胞系LSC的组装明显快于H细胞系。进一步说明LSC的差异极有可能是引起疾病发生的原因。  17、通过研究发现m.14487T>C家系挑选的高低异质率细胞克隆中并没有发现与m.3697G>A突变类似的LSC变化。说明LSC的差异在m.3697G>A中是特异存在的。  18、通过检测L、H细胞系的线粒体相关的功能,L细胞系相比于H细胞系来说,其线粒体的氧耗量较高,膜电位水平较高,线粒体CⅠ产生的相关的ATP水平较高,乳酸及ROS的产生量较低。说明L细胞系的线粒体OXPHOS功能更强。  结论:  1、源于不同人与小鼠的多种细胞系的超级复合体的组成形式不同,由上述的1-5实验结果得出,核基因背景不同影响了超级复合体的组成形式;并且我们发现 LSC的组成形式分为Ⅰn+Ⅲn与Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn。通过LSC中cyt c的检测确认其有完整的呼吸功能。  2、选用HIB1B细胞系(Ⅰn+Ⅲn)与C2C12细胞系(Ⅰn+Ⅲn+Ⅳn)进行LSC的组装与去组装动力学研究。由上述的6-7实验结果得出,C2C12细胞系的组装与去组装较HIB1B细胞系慢。得出结论,包含CⅣ的超级复合体比没有CⅣ的超级复合体更加稳定。  3、通过非变性胶技术对L、H高低异质率细胞系的OXPHOS完整性进行研究,由上述的8-17实验结果得出,可得MT-ND1 m.3697G>A突变损坏了LSC的组成,进而引起疾病的发生。  4、通过线粒体功能方面的检测,确认m.3697G>A突变在生物学功能方面影响了OXPHOS功能。由上述的18-22实验结果得出,H细胞系相较于L细胞系来说,复合体Ⅰ相关的氧耗降低了,MMP降低了,ATP生成减少,乳酸产生量增加,ROS产生量也增加。更进一步确认了该突变损伤了CⅠ进而导致线粒体功能缺陷。
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