含双酰胺键脱氧核糖核酸的构建及其在错配碱基识别中的应用研究

来源 :中国石油大学(华东) | 被引量 : 0次 | 上传用户:cxr1682000
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核酸在生物的遗传过程中扮演着重要的角色,核酸的基本组成单元是核苷酸,核苷酸由碱基、戊糖和磷酸组成,随着科学技术的发展,国内外越来越多的科研工作者投身于对核酸药物的研究。核酸药物研究主要是人们对天然的核酸进行化学修饰,提高细胞对核酸药物的摄取力及对核酸酶的抗性等,化学修饰的方式主要是对核苷的碱基、戊糖、磷酸二酯键进行结构的改进,从而改变所形成核酸的生物化学性质,实现人们对核酸药物的需求。本文针对核酸的骨架修饰,以胸腺嘧啶核苷和齐多夫定为原料,以分子设计为指导,经过多步有机合成,制备了含有双酰胺单元的双脱氧核苷单体,并将其整合到天然DNA结构中,考察了丁二酰胺单元的引入对DNA双链结构及稳定性的影响。我们利用核磁与质谱对合成的核苷单体进行了表征,利用圆二色光谱仪(circular dichroism,CD)、聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyacrylamide gel electrophoresis,PAGE)和紫外可见光谱仪(UV-Vis spectrum,UV)对DNA结构及稳定性进行了研究。研究内容主要包括以下三个方面:(1)设计了含有丁二酰胺单元的双脱氧核苷T-S-T(Thymidine-SuccinecamideThymidine)单体,我们以商业化的齐多夫定和脱氧胸苷为原料,经过多步有机合成,以电中性的丁二酰胺单元将两个胸苷的3’和5’端连接起来,对其5’-羟基采用4,4’-二甲氧基三苯基氯甲烷(DMT-Cl)进行保护,3’-羟基进行亚磷酰胺活化,即可得到目标单体。(2)采用固相合成的方法设计合成了含有不同数量丁二酰胺单元双脱氧核苷单体的DNA序列,并系统研究引入T-S-T单元的数量和位置对于双链DNA二级结构的形成、化学及酶学稳定性的影响。随后,我们又对DNA进行了错配识别研究,研究发现T-ST单元的引入对T:C错配具有较好的识别性能。(3)基于前面研究的基础,我们设计合成了含有不同酰胺键类型的双脱氧核苷T-XT单体,酰胺键(X)的类型主要有顺丁烯二酰胺、戊二酰胺以及邻苯二甲酰胺;此外,我们还进行了含有丁二酰胺单元的T-S-A和T-S-C双脱氧核苷单体的合成。
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