目的：了解参合患者住院费用构成情况,应用递归系统模型和结构方程模型对新农合住院患者医疗费用的分布和影响因素进行分析,并对两种分析方法的结果进行比较,探讨住院费用影响因素研究的适宜统计分析方法,为今后相关问题的研究提供方法上的借鉴,同时也为政府、卫生部门制定卫生政策提供依据。方法：以广西某二级甲等综合医院2010年出院的参合患者病案首页资料和医疗费用信息为研究对象,将收集到的数据导入Excel2003建立数据库,剔除缺失数据,应用SPSS13.0对数据进行一般性统计描述,单因素分析和递归系统模型分析,应用Amos7.0对数据进行结构方程模型分析。结果：住院费用构成中药费的比例最高,占37.52%。其次为其他项目、诊疗费、手术费、化验费、检查费、床位费、护理费；参合住院患者排名前五位的疾病依次为妊娠分娩和产褥期类(22.8%)、损伤和中毒(17.9%)、呼吸系统疾病(13.8%)、循环系统疾病(10.4%)和消化系统疾病(7.7%)；住院费用中位数排名前五位的疾病类别依次为肿瘤(3055元)、循环系统疾病(2920元)、损伤和中毒(2608元)、妊娠分娩和产褥期(1966元)以及内分泌、营养和代谢疾病(1960元)；参合患者住院费用的影响因素有年龄、入院情况、出院转归、是否手术、消化系统疾病、损伤和中毒、循环系统疾病、呼吸系统疾病、血液造血器官疾病、眼和附器疾病、围生期疾病、皮肤和皮下组织疾病、症状与体检异常、其他疾病等。是否手术与出院转归之间、年龄与入院情况之间、住院费用的各项目之间存在相关关系。本次研究未发现性别、婚姻状况等因素对住院费用有影响。结论：通过对2861例参合患者的住院费用进行分析,发现参合患者住院费用构成不合理,药费所占比例过高；损伤和中毒、循环系统疾病患者所占比例大,平均住院费用高：高龄、入院情况危急、手术、死亡患者的住院费用较高；本次研究通过应用递归系统模型和结构方程模型对参合患者住院费用影响因素进行分析,发现不同的因素对住院费用存在直接和(或)间接的影响,并对住院各个费用项目有不同的影响方式。两种方法的研究结果基本一致,各有其特点,递归系统模型方法较为简单、便于操作,既能体现影响因素的层次结构,在筛检主要影响因素方面也具有一定的优越性,而结构方程模型则能挖掘出更多潜在信息,增强统计的效率和精度。