近年来,我国大力推进创新驱动以实现经济的高质量发展,但在转型过程之中依然面临诸多桎梏。其中,创新要素配置存量不足、质量不强以及效率不高等问题突显。但随着各类数字技术的骈兴错出,我国国民经济运行以及人民生活的方方面面都受到了数字经济的冲击。数字经济的迅猛发展给创新要素的高效合理配置提供了契机与思路。数字经济不仅依靠其强大的数字化网络,缩减了创新要素的培育周期,而且大幅拓宽了创新要素流动的空间,降低了创新要素在各个产业、部门以及企业之间的错配,提升了市场中创新要素的供需匹配效率。此外,数字经济还依靠数据这一关键生产要素,以数据流带动人才流、资金流以及技术流的方式有效解决了创新要素配置过程中联动性不强的问题。依托于数字经济的蓬勃发展,创新要素的配置水平和配置效率均得到了大幅提升。因此,明确数字经济与创新要素配置的内在作用机制是当今时代背景下优化创新要素配置的关键。本文的研究不仅对数字经济与创新要素配置的相关研究做出有益补充与拓展,而且所得研究结论能够为地方政府因地制宜和因时制宜地运用数字经济优化创新要素配置提供参考,同时也能够为企业依据自身特点,在数字经济发展浪潮中合理地选择创新要素配置的优化路径提供借鉴。考虑到数字经济发展与创新要素配置之间的相互关联及影响,本文首先从统计学和系统论角度出发,对二者之间耦合协调发展的情况进行测度。在明晰二者之间的基本相关关系后,聚焦数字经济对创新要素配置的因果作用机制。考虑到研发创新是实现创新驱动发展的核心,因此,本文基于研发要素视角,从研发投入水平提升、研发产出质量增强以及研发效率改善三个维度综合评价创新要素配置的优化。在信息经济学、创新理论以及要素配置理论的基础上,运用数理经济学模型探究了数字经济对研发投入水平提升、研发产出质量增强以及研发效率改善的作用机理,同时,运用固定效应模型、无条件分位数回归模型、中介效应模型、面板门槛模型以及空间杜宾模型等计量经济学模型对以上三条研究主线的作用机制进行实证检验。具体而言,本文主要做了如下研究工作。（1）在构建数字经济发展指标体系时,不仅从数字产业化和产业数字化的角度对其进行评价,而且手工收集与数字经济发展相关的法规文本,用其存量衡量地区的数字经济发展环境,这可以在一定程度上表征数字化治理这一数字经济内涵。此外,从人力创新要素、资本创新要素和技术创新要素三方面构建创新要素配置指标体系。在此基础上,运用熵权-灰色关联-Topsis方法和耦合协调度模型测度数字经济与创新要素配置的耦合协调发展情况。从静态和动态双重维度,运用标准差椭圆、Dagum基尼系数、联合核密度估计以及空间Markov链等方法揭示数字经济与创新要素配置耦合协调发展的时空特征及动态演进规律。（2）基于研发要素视角,从研发投入水平提升的角度刻画创新要素配置的优化,探究数字经济发展对研发投入水平提升的作用机制。在理论分析中,系统分析数字经济发展影响企业研发投入水平的作用路径;将数字化转型纳入异质性企业技术选择模型中,刻画数字化转型通过降低企业成本从而提升企业研发投入水平的作用机理;从企业所有权性质、政府补助以及知识产权保护三个方面就数字经济发展促进研发投入水平提升的异质性影响效应展开理论分析。在实证分析中,运用固定效应模型实证检验了数字经济发展对研发投入水平提升的促进效应及其异质性影响。在进一步分析中,运用面板无条件分位数回归模型探究二者之间的促进效应在不同研发投入水平分位点的异质性;运用固定效应模型,探究数字经济发展对研发投入费用化与研发投入资本化的异质性影响。（3）基于研发要素视角,从研发产出质量增强的角度刻画创新要素配置的优化。聚焦数据价值化这一数字经济内涵,从数据要素与人力创新要素匹配的角度来刻画数据要素的价值实现过程。在理论分析中,首先强调数据要素与人力创新要素匹配的必要性,在此基础上,深入分析数据要素与人力创新要素匹配对研发产出质量增强的直接作用路径,构建四部门一般均衡模型探析二者匹配增强研发产出质量的作用机理,并详细分析了二者之间的间接作用路径。在实证分析中,运用固定效应模型和中介效应模型实证检验了二者匹配对研发产出质量增强的影响效应并进行中介渠道检验。在进一步分析中,探究二者匹配增强研发产出质量的非线性影响,并尝试解释其非线性影响效应产生的原因。（4）基于研发要素视角,从研发效率改善的角度刻画创新要素配置的优化。在理论分析中,系统分析了数字经济发展对研发效率改善的作用路径,将数字经济发展纳入包含研发要素市场扭曲的竞争均衡模型中,探析数字经济发展对研发效率改善的作用机理,并详细分析了二者之间的门槛作用效应和空间溢出效应。在实证分析中,运用随机前沿分析方法（SFA）对研发效率进行测算,并比较了各省市研发效率的时空特征与演进规律,运用固定效应模型验证了数字经济发展对研发效率改善的促进效应;在门槛效应分析中,以产业结构高级化和经济发展水平分别作为门槛变量,运用面板门槛模型检验了数字经济发展改善研发效率的门槛作用效应;在空间溢出效应分析中,构建空间杜宾模型检验数字经济发展对研发效率改善的空间溢出影响。基于上述研究工作,本文得到以下主要结论。（1）从时序特征看,全国数字经济与创新要素配置耦合协调发展的水平较低,但具有逐年增长趋势。从空间分布格局来看,数字经济与创新要素配置耦合协调发展的空间区位分布较为稳定,整体呈现偏东北-偏西南走势。从区域差异来源看,各地区之间耦合协调发展的差异性是整体差异的重要原因,但这种差异呈逐年递减趋势,而三大地区内部的差距则呈逐年递增趋势。传统核密度估计显示,全国整体和西部地区存在极化现象。联合核密度估计表明,在全国范围内,耦合协调度在短期内呈现“强者愈强”的发展趋势。传统Markov链分析表明,在长期发展过程中,部分地区的耦合协调发展类型可能实现跨越式增长。空间Markov链的分析结果显示,邻地与本地的“低-低”和“低-中低”集聚模式容易使地区陷入“低质量发展陷阱”,“高-中低”和“高-高”集聚模式可能产生虹吸效应和拥挤效应,拉低本地的耦合协调发展度,使本地的耦合协调发展类型向下转移。（2）数字经济发展显著提升制造业企业研发投入水平,在经过一系列的稳健性检验和内生性探讨后,该研究结论仍然成立。异质性分析发现,二者之间的提升作用在非国有企业、政府补助较高的企业以及知识产权保护度较高的企业中更显著。无条件分位数回归的研究结果显示,在研发投入水平偏低和偏高的分位点,数字经济发展对研发投入水平的促进作用并不显著;在研发投入水平的其他分位点,提升效果随着分位点的提高而增强。相较于研发投入费用化,数字经济发展对研发投入资本化的促进效应更显著。这种促进效应在非国有企业、政府补助较低的企业以及知识产权保护度较高的企业中更为显著。（3）数据要素与人力创新要素的匹配度逐年提升,并且人力创新要素的积累逐渐呈现出落后于数据要素积累水平的趋势。数据要素与人力创新要素匹配显著增强制造业企业研发产出质量,单独的数据要素或人力创新要素对制造业企业研发产出质量的影响不显著。异质性分析表明,二者匹配对研发产出质量增强的促进效应在中部地区企业、劳动密集型企业以及金融约束程度较低的企业中更显著。中介效应检验表明,二者匹配通过形成资金蓄水池效应、市场需求挖掘效应以及供应链柔性响应效应增强制造业企业研发产出质量。进一步分析表明,二者匹配对制造业企业研发产出质量具有倒“U”型的非线性影响,但处于倒“U”型曲线下降区间的样本仅占总样本的2.4%左右,与基准回归中线性模型反映的平均效应并不矛盾。经过检验发现,生活成本的创新挤出效应可能是二者匹配抑制研发产出质量增强的重要原因。（4）数字经济发展显著改善了地区规模以上工业企业的研发效率。随着产业结构高级化与经济发展水平的变化,地区数字经济发展对研发效率的影响具有门槛效应。当产业结构高级化程度小于门槛值时,数字经济发展对研发效率的改善作用较显著;当产业结构高级化程度跨越门槛值后,数字经济发展对研发效率的改善作用减弱。当经济发展水平低于门槛值时,数字经济发展对研发效率改善表现出抑制作用,但不显著;当经济发展水平高于门槛值时,数字经济发展对研发效率改善具有显著促进作用。此外,数字经济发展对研发效率改善具有显著的负向空间溢出效应。这表明,数字经济发展显著抑制了邻域的研发效率改善。本文的逻辑主线遵循:从外在的动态关联关系分析聚焦至内在的因果作用机制分析。首先,从系统论和统计学的角度出发,明晰数字经济与创新要素配置之间的基本相关关系。而后,运用数理建模与计量经济学模型,聚焦数字经济对创新要素配置的因果作用机制。本文可能的创新之处在于:（1）依据数字经济与创新要素配置的内涵,构建了较为全面、系统和科学的数字经济发展与创新要素配置的评价指标体系。其中,通过手工收集各地区的数字经济政策法规文本,以其存量衡量地区数字经济发展环境,尝试反映数字化治理这一数字经济内涵。在此基础上,首次聚焦数字经济发展与创新要素配置之间的动态关联关系,从静态和动态双重视角出发,揭示了数字经济与创新要素配置耦合协调发展的时空特征与动态演进规律。（2）以研发投入水平提升刻画创新要素配置的优化,依据数字经济降低企业成本从而提升研发投入水平这一作用路径,构建企业异质性技术选择模型,解析数字经济发展提升研发投入水平的作用机理。运用分组回归与无条件分位数回归方法深入剖析二者之间的促进效应在多个维度的异质性。（3）以研发产出质量增强刻画创新要素配置的优化,聚焦数据价值化这一数字经济内涵,以数据要素与人力创新要素匹配体现数据要素的价值化过程,依据数据要素与人力创新要素匹配提升新知识发现概率从而增强研发产出质量这一作用路径,构建四部门一般均衡模型,解析二者匹配增强研发产出质量的作用机理。在构建数据要素评价指标体系的基础上,运用中介效应模型深入分析二者匹配增强研发产出质量的作用渠道。此外,还对二者匹配与研发产出质量之间可能存在的非线性关系展开进一步分析。（4）以研发效率改善刻画创新要素配置的优化,依据数字经济缓解研发要素市场扭曲从而改善研发效率这一作用路径,构建包含研发要素市场扭曲的竞争均衡模型解析数字经济改善研发效率的作用机理。在实证检验中,将产业结构高级化和经济发展水平分别作为门槛变量,运用面板门槛模型分析数字经济发展对研发效率改善的门槛作用效应;运用空间杜宾模型检验二者之间的空间溢出效应。