目的通过对于回盲部间置肝管十二指肠吻合术及胆肠Roux-en-y吻合术在先天性胆总管囊肿患者治疗中应用的回顾，比较两种手术方式的操作难易、对患者的创伤、手术花费、近期疗效、抗返流能力及远期疗效的差异，以对今后临床中应用此两种胆道重建术取得更好的远期疗效提供借鉴和参考。方法选取泰山医学院附属医院1988年10月～2012年12月因先天性胆总管囊肿施行回盲部间置肝管十二指肠吻合术及胆肠Roux-en-y吻合术的38例患者进行回顾分析。其中回盲部间置肝管十二指肠吻合术16例（A组），胆肠Roux-en-y吻合术22例（B组）。首先通过回顾患者住院病例资料，对A、B两组的手术时间、术后进饮食时间、住院时间、住院花费及近期并发症率进行对比分析；其次通过回顾患者的随访资料，对两种手术方式的抗返流能力、远期并发症情况及远期疗效进行对比分析。上述比较中，计量资料组间采用t检验，计数资料组间比较采用Fisher’s确切概率法， P＜0.05时认为差异有统计学意义。结果两组胆道重建术在住院时间、住院花费及术后近期并发症率方面相比，经统计学分析，P＞0.05，无显著性差异；在手术时间及术后进饮食时间方面相比，胆肠Roux-en-y吻合术较回盲部间置肝管十二指肠吻合术均较短，经t检验分析， P＜0.05，有显著性差异；两种手术方式在抗返流能力、返流性胆管炎发生率及远期疗效方面相比，回盲部间置肝管十二指肠吻合术均优于胆肠Roux-en-y吻合术，经统计学分析，P＜0.05，有显著性差异。结论(1)在先天性胆总管囊肿的治疗中，选取抗返流能力较强的胆道重建术是提高远期疗效的关键。(2)回盲部间置肝管十二指肠吻合术其抗返流能力强，应为病情单一患者的首选胆道重建术式；胆肠Roux-en-y吻合术操作简便，创伤较小，适用于病情复杂的患者。(3)施行各种胆道重建术都应保证胆肠吻合口宽大，建议使用胆肠端-端吻合，避免术后形成盲端。