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肝细胞癌是世界范围内最为常见的恶性肿瘤之一,并且其形成和发展的分子病理机制十分复杂。研究发现肝癌基因组中大量基因存在突变和拷贝数异常,其中癌基因的激活与抑癌基因的失活是导致肝癌发生发展的关键环节之一。因此,寻找肝癌中新的关键癌基因或抑癌基因,对阐明肝癌发生发展的分子机制、制定新型靶向治疗策略具有重要意义。为了寻找新靶点,本研究通过生物信息学方法整合分析了CNV及基因表达谱的数据。我们从TCGA数据库下载了442例肝癌样本的CNV数据,根据GISTIC法计算出肝癌基因组中拷贝数显著缺失的区域,结果发现13q14.2及1p36.31染色体区域拷贝数异常最为显著,该区域共覆盖了48个基因。同时,我们从NCBI GEO数据库中下载了6个大样本表达谱芯片数据集,并进行大规模的meta分析,筛选出肝癌与非癌组织间显著差异表达的基因集。发现位于13q14.2的含RCC1和BTB结构域蛋白2(Regulator of chromosome condensation(RCC1)and BTB(POZ)domain containing protein 2,RCBTB2)是肝癌中差异下调最为显著的基因,但该基因的功能目前尚不完全清楚,需进一步进行探讨。本研究通过免疫组化技术检测了123对临床肝癌样本及其相应癌旁组织中RCBTB2的表达情况,并分析了RCBTB2与临床病理参数之间的相关性。此外,本研究还利用western blot检测了随机选取的8对肝癌/癌旁组织中RCBTB2蛋白表达情况。结果发现RCBTB2在肝癌组织中显著低表达,RCBTB2的表达水平与病理分级、脉管侵犯、TNM分期相关。为进一步研究RCBTB2在肝癌细胞中的生物学功能,本研究通过克隆形成实验发现过表达RCBTB2,HepG2细胞的克隆形成能力减弱;通过细胞周期实验发现过表达RCBTB2,细胞周期进程阻滞在G0/G1期。另外我们还检测了RCBTB2对初级纤毛形成的影响,通过在NIH3T3细胞中转染shRNA-RCBTB2质粒,利用免疫荧光实验观察纤毛形成情况,发现干扰RCBTB2的表达可以阻断初级纤毛形成,纤毛数目明显减少。综上所述,本研究通过生物信息学分析方法发现:染色体13q14.2在肝癌组织中显著缺失,且伴随RCBTB2 mRNA水平下降;组化和western blot实验发现,RCBTB2在肝癌组织中显著低表达,并与不良临床病理特征相关;细胞实验发现:RCBTB2抑制细胞增殖且与初级纤毛的形成密切相关。本项研究为进一步研究RCBTB2的生物学功能奠定了基础,也为肝癌发病机制研究及其靶向治疗提供了新思路。