随着人类社会进入知识经济时代，技术创新能力越来越成为国际竞争的制高点，各国纷纷完善和加强自身创新系统的建设，加大对科技创新的投入、推动自主创新能力的提高。在研发创新领域，团队已成为自主创新活动的主要组织形式，并随着科技的进步、创新要求的提高，体现出团队的自组织现象，形成一种新型、自主、动态的团队形态——自组织研发团队。如何对自组织研发团队进行激励，是目前自主创新活动中亟待解决的重要问题之一。 本文首先对自组织理论和团队激励理论进行了较详尽的综述，并对自组织研发团队的内涵进行界定，分析自组织研发团队的运作机理和特征。通过分析目前自主创新和团队激励的现状，从宏观和微观角度分别对影响自组织研发团队激励的因素进行剖析，为团队激励机制的设计和激励体系的构建奠定了基础。在团队激励机制的设计中，文章根据自组织研发团队的特点，基于委托-代理理论设计了团队合作的激励模型，实现外部组织对团队的激励；基于合作博弈理论设计了团队利益分配下的激励模型，其目的是协调团队整体目标和成员个体目标的一致性，健全分配制度，促进团队合作。在自组织研发团队激励体系的构建中，将组织激励与团队自我激励相结合，通过团队内外激励的共同作用，发挥团队合力。 自组织研发团队会随着自主创新要求的不断提高而显示出其独特的优势，并被越来越多的组织所采用。本文希望通过对自组织研发团队激励问题的研究和探讨，为自主创新活动中的团队管理实践提供借鉴。