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分子生态学与生态适应是当前生态学的研究热点。而针茅(Stipa)是欧亚草原的典型代表，以期丰富的种内与种间生物多样性适应不同的草原环境，是遗传多样性(genetic diversity)与环境相关性研究的理想材料。克氏针茅（Stipa krylovii）和短花针茅(Stipa breviflora)分别是中国北方典型草原与荒漠草原主要建群和优势种，也是针茅属(Stipa L.)光芒组(Sect.Leiostipa Dum．)和须芒组(Sect.Barbatae Junge)的典型代表种。本项研究利用RAPD技术，通过Neis和Shannon等多样性指数分析及Mantel检验，对分布于内蒙古高原及青藏高原15个克氏针茅(Stipa krylovii)种群和10个短花针茅(Stipa breviflora)种群遗传多样性及其生态适应性进行分析，结果如下：
1.统计得到克氏针茅种群的多态位点百分率为96.22％，而短花针茅种群的多态位点百分率为95.37％。由Shannon指数计算得到克氏针茅种群总的遗传多样性指数为0.4447，短花针茅种群总的遗传多样性指数为0.3694。两种针茅的遗传多样性均较高，并且，克氏针茅的遗传多样性水平高于短花针茅。说明2种针茅的适应性都较强，但克氏针茅适应环境的能力更强。
2.Neis指数和Shannon指数计算结果显示，同一针茅的遗传变异主要发生在不同种群之间，同一种群内的不同个体遗传变异较小。
3.随着研究尺度的缩小，遗传分化GST减小，基因流增大，这说明在相对小的尺度上针茅的遗传分化小，在较大的尺度上遗传分化大。