目的：比较研究Y染色体AZFc区完全缺失对胚胎及临床妊娠结局的影响，在分子和基因水平为临床治疗男性不育提供遗传方面的依据。方法：收集2017年6月-2020年6月就诊于新疆佳音医院生殖医学中心男科门诊的男性不育患者的临床资料，将精子浓度小于5×106/mL、应用高通量测序法检测了Y染色体AZFc区是否有缺失并符合本研究其他纳入、排除标准的403例患者作为研究对象。依据测序结果分为完全缺失组(45例)和未缺失组(358例)，比较两组患者及其配偶的年龄、配偶BMI、不育年限、男方精液分析结果、生殖激素、Gn使用剂量、Gn使用天数、基础AMH、窦卵泡数、MⅡ卵数，比较两组行卵胞浆内单精子显微注射后的受精率、卵裂率、优质胚胎率、胚胎着床率、早期流产率、移植周期临床妊娠率。结果：完全缺失组极重度少弱精子症占比显著高于未缺失组(P＜0.05)，男方生殖激素异常(P＜0.05)，行ICSI后的受精率、优质胚胎率、移植周期临床妊娠率降低(P＜0.05)，其余指标比较差异无统计学意义(P＞0.05)。结论：Y染色体AZFc区完全缺失的临床表现以极重度少、弱精子症为主，存在男性生殖激素功能紊乱，是造成受精率、优质胚胎率和移植周期临床妊娠率降低的主要病理因素之一。