石韦属(Pyrrosia Mirbel)主产于热带和亚热带地区,尽管前人对其开展了大量的研究工作,包括分类、种间关系、分支分析和化学成分分析等,但是该属的属下划分一直存在较大争议。在分子系统学方面,前人对石韦属开展的工作很少,而且对属内的一些杂交事件缺乏深入探讨。在本研究中,我们利用母系遗传的叶绿体基因和双亲遗传的核基因序列分析,对水龙骨科石韦属进行了初步的系统发育重建,探讨了石韦属的一些种间关系和抱树莲的杂交起源。　　 我们依据Hovenkamp(1986)对石韦属的属下划分,选择了10个群(group)中的7个群、共15个物种(含2个变种,并包括不属于任何群的两个物种),对其叶绿体DNArps4-trnS区以及核基因LEAFY的两个内含子进行了序列测定。基于叶绿体基因构建的系统发育树将石韦属分为四支:下延石韦(Pyr.costata)位于最基部,为其他石韦属物种的姐妹类群;第二支包括四个物种和一个变种,石蕨(Pyr.angustissima)位于基部;抱树莲(Pyr.piloselloides)位于第三支的基部,并且和披针石韦(Pyr.lanceolata)聚为一支;第四支包括八个物种和一个变种,内部分支支持率较低,而且这些物种在形态上也难以区分。以核基因LEAFY构建的系统发育树和叶绿体基因树均支持石韦属为一个单系类群,然而它们的内部拓扑结构却存在着明显的不一致,推测石韦属曾经发生种间杂交并导致网状进化。抱树莲在叶绿体和核基因树上位于明显不同的位置,显示该物种很可能为杂交起源,并且极有可能通过无融合生殖的方式固定下来。通过分子钟的度量,该杂交事件大致发生在渐新世。　　 另外,结合NCBI公布的石韦属部分物种的叶绿体DNA序列,与我们测定的序列进行联合分析,进一步对石韦属9个群的26个物种(含2个变种)进行了系统发育重建,结果仍支持该属为一个很好的单系类群,同样分为明显的四个主要分支。基于该基因树,我们利用Mesquite软件对石韦属7个形态性状的演化历史进行了分析,发现其中一些性状(如叶片星状毛类型、气孔下陷程度、维管束数量等)可能不是一次起源或是祖征在不同支系中的保留。