目的:探索肝癌与胆管癌患者的癌组织与癌旁组织中是否存在菌群,菌群的种属、多样性及丰度等是否存在差异,从而明确肝癌及胆管癌与菌群的相关性。方法:选择15例胆管癌及15例肝癌患者,术中留取标本,通过严格的无菌操作留取术中的肝癌及胆管癌患者肿瘤标本及癌旁组织在无菌环境下分别储存。在Illumina Hi Seq测序平台上,采取双末端测序(Paired-End)的方法对肝癌及胆管癌癌组织标本及癌旁组织进行细菌菌种分布的测序分析。结果:肝癌、胆管癌组织及癌旁组织的高通量测序结果,提示癌组织及癌旁组织内均有细菌的存在,对菌群的丰度、多样性从OTU数、Ace指数、Chao指数和Shannon指数来比较,两组数据从物种丰度(Chao1和Ace)的差异无统计学意义(P>0.05),从物种多样性(Shannon)的差异均无统计学意义(P>0.05)。故肝癌及胆管癌组织和癌旁组织的丰度、多样性均无明显差异。结论:通过肝癌、胆管癌及癌旁组织的高通量测序结果,提示肝癌、胆管癌及癌旁组织均存在细菌,从癌组织及癌旁组织的菌群门、属分析,肝癌、胆管癌及癌旁组织在优势菌群比例差异明显,且菌群分类与肠道菌群的门、属分类基本一致,提示胆管癌、肝癌的发生发展可能与菌群有关。