隐孢子虫、毕氏肠微孢子虫和十二指肠贾第虫是三种常见的人畜共患肠道寄生虫,可通过多种途径传播,在世界范围内广泛流行,可感染人类、哺乳动物和多种鸟类。感染这三种寄生虫均可引起宿主发生腹泻,免疫力正常的宿主可发生自限性腹泻,免疫缺陷的宿主可发生持续性水样腹泻,严重者可导致死亡。因此这三种肠道寄生虫对公共卫生、人类健康和畜牧业经济发展构成严重威胁。目前,随着经济的发展,鸟的需求量不断增加,养鸟的人也越来越多,人与鸟的接触更加频繁,但是鸟作为许多肠道寄生虫的宿主,不但活动范围广泛,而且种类繁多,大大增加了人畜共患寄生虫向人类传播的风险,严重威胁人类健康。为了解河南省地区鸟肠道寄生的流行情况,本研究采样卢戈氏碘液染色法和饱和蔗糖水漂浮法对河南省404份鸟粪便样品进行显微镜检查,肠道寄生虫总感染率为73.51%。3.96%(16/404)的样品混合感染2种寄生虫。本研究共检测出6种肠道寄生虫,其感染率分别为球虫63.37%、圆线虫5.45%、细颈线虫0.50%、毛细线虫2.72%、蛔虫3.96%和吸虫1.49%,球虫为优势虫种。为了解河南省地区鸟隐孢子虫、毕氏肠微孢子虫和十二指肠贾第虫的流行情况和虫种/基因型,从河南省7个地区采集1005份鸟粪便样品,基于SSU rRNA基因位点,进行巢式PCR扩增隐孢子虫,结果发现21份隐孢子虫,总感染率为2.09%。不同地点鸟隐孢子虫感染率为0-3.80%,感染率统计学差异极显著(P<0.01)。开封感染率最高为3.80%,濮阳、驻马店和南阳未发现阳性样品,郑州、洛阳和漯河的感染率分别为2.95%、3.70%、1.32%;共发现5种隐孢子虫,分别为C.meleagridis(4/21)、C.galli(5/21)、C.baileyi(10/21)、C.andersoni(1/21)和 C.parvum(1/21)。C.baileyi为优势虫种。C.meleagridis、C.andersoni和 C.parvum具有人畜共患性。基于ITS基因位点,通过巢式PCR共扩增出45份毕氏肠微孢子虫,总感染率为4.48%,仅在鸽子和斑鸠粪便样品中检测到阳性样品。其感染率分别为8.18%和27.78%。共鉴定出2种基因型即Peru 6(44)和PtEb Ⅰ(1),Peru 6是优势基因型,且属于Groupl,具有人畜共患性。基于SSU rRNA基因进行巢式PCR扩增十二指肠贾第虫,总感染率为3.28%。经鉴定发现阳性样品均属于集聚体E。综上所述,通过对河南省地区的鸟进行隐孢子虫、毕氏肠微孢子虫和十二指肠贾第虫进行流行病学分析和人畜共患风险评估,为人和动物隐孢子虫病、微孢子虫病和贾第虫病的预防和控制提供科学依据。