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2000年以后,中国养禽业快速发展,但快速发展的同时,也产生了一系列问题,如抗生素的滥用,致使耐药菌大量出现,严重威胁了动物及人类的健康。因此,如何解决这个问题成为当下研究热门。本文旨在探讨一种中药复方发挥促生长作用的可能机制,为解决抗生素耐药性提供一个潜在研究方向。选取20只36日龄左右,体重相近的文昌鸡,随机均分为2组,中药组和对照组,所有鸡均被系上脚环以作标记。中药组鸡饲喂添加0.5%的中药复方的饲料,对照组鸡饲喂正常饲料。分别于36 d(试验第一天)、46 d、53 d、61 d、71 d、80 d、94 d和115 d每天早上8点收集新鲜的文昌鸡粪便,提取粪便总DNA并使用Miseq测序。试验结果如下:1.中药组鸡肠道菌群的多样性指数Chao1、ACE在36d、46d和61d均显著高于空白对照组。此外,肠道菌群的多样性指数Chao1、ACE和Shannon指数会随着文昌鸡日龄的变化而变化。2.PCA与PCoA分析显示,中药组与对照组有分开的趋势,其中中药复方对二者差异的贡献率达36.00%,而不同时间点的样品则分开趋势较为明显。3.NMDS分析显示,与日龄相比,中药复方对鸡肠道菌群多样性的影响较为显著。4.物种丰度差异性显示,在门分类水平上,厚壁菌门、变形菌门与拟杆菌门是鸡肠道内丰度比例最高是绝对主要菌群,而且随着日龄的增长,厚壁菌门的丰度比例逐渐降低而拟杆菌门则逐渐升高,中药组鸡肠道中放线菌门和梭杆菌门的丰度比例显著低于对照组;在纲分类水平上,中药组鸡肠道中的变形菌纲和疣微菌纲的丰度比例显著高于对照组,而螺旋原虫纲和蓝菌纲的丰度比例则显著低于对照组;在属分类水平上,中药复方使鸡肠道内Acidovorax、Anaerofilum、Anaerofustis等菌属的丰度比例发生显著性变化,最有意义的是显著提高了有益菌Lactobacillus的丰度比例。结论:1.该中药复方可以显著改变文昌鸡肠道菌群多样性,并且主要是通过调节肠道内丰度比例小于1%的菌群也就是稀有菌来实现的。2.该中药复方可以通过促进动物的生长的目的,为研究中药复方促生长的机理在商业化鸡场生产应用中提供了参考意义。