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目的：检测ⅢA型CP/CPPS患者精液中ncRNA的表达谱,并对健康男性和ⅢA型CP/CPPS患者精液中miRNA进行筛选。方法：筛选ⅢA型CP/CPPS患者,留取精液作为疾病组,以健康成年男性精液作为对照,分别提取总RNA。通过胶回吸收方法收集ncRNA,引入3’和5’adaptor接头,RT-PCR方法建立ncRNA cDNA文库,采用solexa高通量测序技术分析两组患者精液中ncRNA表达情况,并对比分析患者精液与正常精液中miRNA差异表达,筛选出主要差异表达的miRNA分子。结果：1、疾病组中的特有序列与Genbank中ncRNA进行比对,发现1341489个序列中rRNA117574个、scRNA7300个、snRNA4347个、snoRNA889个、tRNA49431个、其他1161948个；疾病组的公共序列与Genbank中ncRNA进行比对,发现39833420个序列中rRNA13484159个、scRNA1017352个、snRNA328085个、snoRNA5364个、tRNA5245222个、其他19753238个。2、最终纳入差异分析的miRNA共486个,疾病组与对照组差异分析。发现52个miRNA表达上调,袅达下调156个,其余278个miRNA经差异分析未发现明显变化；表达差异明显的分子有miR-203、miR-363、miR-221、miR-664、 miR-146、miR-25、miR-423。表达下调的主要有miR-378,miR-203, miR-185, miR-181等,表达上调的主要有miR-24, miR-363, miR-221等。结论：1、研究发现ⅢA型CP/CPPS患者精液ncRNA中miRNA具有较高含量,可作为研究ⅢA型CP/CPPS患者的检测指标。2、ⅢA型CP/CPPS患者精液中miRNA差异筛选发现,纳入分析系统的miRNA共486个,实验组与对照组差异分析,发现表达上调的52个,表达下调156个,其余278个miRNA经差异分析未发现明显变化。3、筛选出miRNA可能与ⅢA型CP/CPPS的发生、发展有关。