非小细胞肺癌基因共同突变及表达异常的初步研究

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肺癌是肿瘤发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一,其中非小细胞型肺癌大约占肺癌的85%。近年来肺癌立体定向消融放射治疗、靶向治疗和免疫治疗等方面取得了显著进展,其5年生存率较前有大幅提高,特别是EGFR突变获益更多,但部分靶点阳性突变病人存在预后仍然较差的状况。有研究表明,TP53和EGFR的共突变通常加速癌细胞的增殖和侵袭而导致较差的预后,也有研究表明,PTEN和EGFR共突变同样影响患者的预后。因此,进一步研究影响生存和预后的非靶点基因的异常表达或突变有非常重要的临床意义。本研究旨在探索相关基因突变及表达对非小细胞肺癌患者预后生存的关系,为临床治疗非小细胞肺癌提供更多的实验依据。目的本研究拟探讨非小细胞肺癌相关检测基因共同突变及表达对于患者生存预后的影响,分析不同基因突变与患者病例特征的关系,通过基因表达间的相关性研究不同亚组患者的预后倾向等。方法R软件包分析从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载的基因表达数据和临床数据,收集荆州市第一人民医院近5年500例非小细胞肺癌患者样本及其基因检测资料,并进行整理及随访,调查患者生存预后情况。之后进行多变量Cox回归分析和生存分析等研究。结果1.对来自TCGA的基因表达数据的分析表明,影响总体生存率的单基因过度表达为TP53(P=0.79)、PTEN(P=0.94)、RB1(P=0.49)、CTNNB1(P=0.24)、STK11(P=0.32)和PIK3CA(P=0.013)。然而,多基因(TP53、PTEN、RB1和STK11)表达量影响生存率的概率为0.025。2.临床资料的回顾性分析显示性别(风险比[HR]=1.29[95%CI:0.64-2.62])、年龄(HR=1.05[95%CI:1.02-1.07])、吸烟状况(HR=2.26[95%CI:1.16-4.39])、肿瘤组织学(HR=0.58[95%CI:0.30-1.11])、肿瘤分期(HR=16.63[95%CI:4.8-57.63])、表皮生长因子受体(EGFR)突变(HR=1.82[95%CI:1.05-3.16])、丰度(HR=4.95[95%CI:0.78-31.36])和酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)治疗(HR=0.58[95%CI:0.43-0.78])影响患者生存。3.TP53、PTEN、RB1和STK11的共同突变对接受化疗的患者的总生存率没有显著影响(P=0.96),但对接受TKIs的患者的总生存率有显著影响(P=0.045),化疗组中的0/1/GT1组的中位OS为5/9/6.5月,靶向治疗组中0/1/GT1组的中位OS为28/22/15月。Log-Rank test检验结果的P值分别为1和0.049。4.基因表达量分析中,CTNNB1、MET、ERBB2、EGFR和AKT1个体间差异明显。EGFR表达和大部分基因表达均为负相关,除了TERT和NRAS。KIT和TERT基因在KRAS中较EGFR突变组表达有明显提高,RET基因在KRAS突变患者中存在一群过表达的离散值。结论不同基因的共同突变或过度表达对患者的总体生存和预后有不同的影响。联合TKI治疗,TP53、PTEN、RB1和STK11的共同突变可能对NSCLC患者的生存和预后产生协同效应。
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