常规抗结核药物治疗对痰液和肠道菌群的影响

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目的(1)研究初诊肺结核病患者在常规抗结核药物治疗过程中痰液菌群的变化;(2)探讨结核分枝杆菌感染及常规抗结核药物治疗对肠道微生物组和代谢组的影响。方法(1)纳入103名结核病患者,其中初诊未治的结核病患者54人(T0组)、一线抗结核药物治疗2个月的结核病患者32人(T2组)、治疗6个月且治愈的结核病患者17人(T6组)。利用高通量测序技术对痰液菌群16S r DNA进行测序,随后对测序数据进行生物信息学分析。(2)招募168人作为研究对象,其中健康人49人(HV组)、结核分枝杆菌潜伏感染者30人(LTBI组)、初诊未治的结核病患者41人(ATB组)、治疗2个月的结核病患者28人(A2组)、治疗6个月且治愈的结核病患者20人(A6组)。利用高通量测序技术对肠道菌群的16S r DNA进行测序,随后分别对HV、LTBI、ATB三组以及ATB、A2、A6三组的测序数据进行生物信息学分析。利用非靶向液相色谱质谱法对HV组、ATB组、A2组和A6组的粪便样本进行代谢组学分析,最后对差异代谢物及差异菌群进行Spearman相关性分析。结果(1)T2组和T6组的α多样性指数低于T0组(Pielou_e指数除外),且随着治疗时间的延长,α多样性指数明显降低;β多样性分析结果显示,三组样本的菌群结构存在显著差异;LEf Se分析结果显示在不同分类学水平上共鉴定出61种差异菌群;PICRUSt功能预测分析显示相较于未治的T0组,抗结核治疗后痰液菌群的脂肪酸代谢、丁酸盐代谢、细菌迁移等功能途径发生改变。(2)HV组与LTBI组的α多样性指数无显著差异;与HV组和LTBI组相比,ATB组的α多样性指数均显著下降;β多样性分析结果显示ATB组肠道菌群的群落结构与其他两组相比存在着显著的差异;LEf Se分析结果显示,HV组与ATB组中共鉴定出48种差异菌群。与ATB和A2组相比,A6组的α多样性高于其他两组且差异有统计学意义;β多样性分析结果显示只有ATB组与A6组的肠道菌群结构存在着差异;LEf Se分析结果显示在不同分类学水平上共获得了18种差异菌群。粪便代谢组学的分析结果显示,与HV组相比,ATB组、A2组、A6组分别鉴定得到63种、142种、53种具有显著差异的代谢物;Spearman相关性分析结果显示,结核分枝杆菌感染或抗结核药物治疗引起的粪便代谢物的改变与肠道微生物群丰度的改变有关。结论(1)抗结核治疗很大程度上扰乱了痰液菌群的组成和功能,这会导致肠道菌群的代谢发生改变,最终影响机体对结核分枝杆菌的免疫应答。(2)活动性肺结核患者肠道菌群的多样性明显降低,但随着抗结核治疗时间的延长,肠道菌群的多样性有一定程度的恢复。结核病患者肠道菌群中某些发生显著改变的菌群未来可作为结核病的诊断标记物;结核分枝杆菌感染和抗结核药物治疗可导致结核病患者的肠道微生物群和代谢组发生改变,揭示肠道菌群和代谢物与结核病的发生发展存在潜在的相关性,这可为结核病的诊断或治疗效果的评估提供潜在的生物标志物。
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