目的:探讨肠道病毒(EV)感染在流行季节发热新生儿中的发生率、临床特点以及危险因素。肠道病毒感染的危险因素分析有助于我们对有高危因素的患者及时采取相应的防治策略。方法:收集2011年和2012年夏秋季新生儿病房住院患儿共334例进行前瞻性对照分析。对所有发热病例收集粪便或脑脊液标本,采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)法检测肠道病毒RNA。粪便或脑脊液标本之一检测为阳性者,纳入肠道病毒感染组,未能检测到肠道病毒者纳入非肠道病毒感染组。对两组患者的临床资料(包括:胎龄、性别、出生体重、发病年龄、早产、分娩方式、胎膜早破、母乳喂养、母亲年龄、最高体温、发热持续时间、母亲发热病史、白细胞、血红蛋白、血小板减少、C反应蛋白、血清白蛋白、血清总胆红素、谷丙转氨酶、血肌酐、血尿素氮、肌酸激酶同工酶MB、脑脊液检测异常、细菌培养阳性、住院时间情况)进行统计分析,了解新生儿肠道病毒感染的临床特征和危险因素。结果:所有发热患儿均行肠道病毒RNA检测,分别检测粪便样本334例和脑脊液样本共221例。其中131例肠道病毒RNA检测阳性,肠道病毒感染占同期住院发热新生儿39.22%。在131例肠道病毒感染患儿中,脑脊液标本检测到肠道病毒RNA58例,占 44.27%,其脑脊液中有核细胞数(2-668)×106/L,(100.38±147.97)×106/L。粪便标本肠道病毒RNA阳性检出率为38.92%(130/334),较脑脊液标本的检出率26.24%(58/221)高(X2=9.543,P<0.01;OR:1.791;95%CI:1.235-2.597),且表明利用粪便样本进行肠道病毒RNA检测,阳性检出率将较脑脊液提高1.791倍。多因素Logistic回归分析显示:脑脊液检测异常(OR:12.426,95%CI:5.633-27.413)、血小板减少(OR:3.647,95%CI:1.312-10.136)、发热持续时间>3.25(d)(OR:2.293,95%CI:1.279-4.113)、最高体温>38.35(℃)(OR:2.094,95%CI:1.342-4.123)、细菌培养阴性(OR:5.073,95%CI:1.504-17.114)为新生儿肠道病毒感染的危险因素。结论:1、在发热新生儿中,尤其是肠道病毒流行季节,肠道病毒应纳入常规检测行列。2、脑脊液检测异常、血小板减少、发热持续时间>3.25(d)、最高体温>38.35(℃)、细菌培养阴性为新生儿肠道病毒感染的危险因素。