基于转录组学的小菜蛾脑神经肽的鉴定与表达规律研究

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xi19870623
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本文对小菜蛾脑组织转录组进行了测定及分析,明确了幼虫期脑组织中基因的组成和种类以及它们在菜蛾盘绒茧蜂寄生后的数字表达谱,从中鉴定出一批脑神经肽基因,并用qrt-PCR的方法检测和比较了他们在寄生和未寄生小菜蛾脑组织中的表达模式。现将结果总结如下:1.小菜蛾脑组织转录组测序及功能注释使用Illumina测序技术对小菜蛾脑组织转录组进行测序,共得到7,115,762个reads,总长度为1,280,837,160个核苷酸,reads平均读长为180bp。Reads通过系列拼接得到42,441个unigene序列。E值的阈值为1.0E-5时有19,144个unigene在Nr有序列相匹配。可注释序列中85.5%的比对结果E值在1.0E-50到1.0E-5之间;相似度的分析发现34.6%的序列与比对上序列的相似度大于60%。比对时排第一的序列进行物种分析发现,比例最大的是意大利蜜蜂26.3%,同为鳞翅目的家蚕占5.79%。2.神经肽基因的鉴定根据Nr功能注释结果,发现转录组数据中有19种已知的神经肽基因EST序列,它们是:Allatostatin A(AstA), Allatostatin C (AstC), Allatotropin (AT), Allatotropin (AT)、Bursicon (BUR)、Partner of Bursicon (PBUR)、CCHamide、 CHH-like protein precursor、Crustacean cardioactive peptide (CCAP)、Diuretic hormone isoform DH45precursor、FMRFamide、FMRFamide-related peptides (FaRPs)、Ion-transport peptide、precursor-like protein (ITP)、Leucokinin (LK)、 Neuroparsin、Neuropeptide F2(NPF2)、Neuropeptide-like precursor1(NPLP1)、 Prothoracicotropic hormone precursor (PTTH)、Short neuropeptide F (sNPF)、 Tachykinin (TK)、Tachykinin (TK)。通过反转录PCR验证了其中6个神经肽基因的存在,即:A型咽侧体抑制肽AstA,咽侧体活化肽AT,鞣化激素BUR及PBUR,促前胸腺激素PTTH和类甲壳心律肽CCAP。3.小菜蛾脑组织数字基因表达谱测序本论文共测了小菜蛾3龄中、3龄末及被菜蛾盘绒茧蜂寄生后12、24、48、72、120、168小时等不同发育时期脑组织的数字基因表达谱,发现寄生24小时与3龄末相比上调基因有1974个,下调基因有1749个,但神经肽同源序列没有显著变化;差异表达基因中有517个可以匹配到GO功能聚类中,其中下调基因有433个。4.神经肽转录水平表达模式分析通过实时定量PCR方法对6个已验证的神经肽基因的表达模式及寄生的影响进行了分析。研究发现,所有6个神经肽基因总体上在3龄末有一个表达高峰,4龄和蛹初期基本处在较低点,蛹末期相对表达量回升。被菜蛾盘绒茧蜂寄生后,6个神经肽基因在3龄末的表达高峰均被抑制,且表达量基本保持与未寄生时相当的水平。
其他文献
目的:研究低盐膳食联合降压药物联合治疗社区高血压病的效果.方法:选取2017年1月―2018年6月60例社区高血压老年患者作为对象研究,并将患者分为观察组和对照组,观察组为常规
目的:对肝胆外科手术切口感染进行多因素分析并给予对策.方法:回顾性分析我院2016年2月至2018年2月收治的120例肝胆外科手术患者的临床资料.结果:患者手术中的血清白蛋白、胆
目的:探讨固定矫治器双弓丝结扎术在外伤性牙脱位治疗中的应用效果.方法:选取2017年3月至2018年3月我院40例外伤性牙脱位患者为研究对象,所有患者均采用固定矫治器双弓丝结扎
哈茨木霉是一种重要的生防真菌,具有拮抗广谱性、适应性强和多重作用机制等特点。实验室早期对哈茨木霉Gα蛋白基因Thga1进行了敲除,发现敲除菌株相对原始菌株分生孢子梗数和分
目的:探究心律失常应用胺碘酮、普罗帕酮治疗的临床效果.方法:随机选择本院收治的心律失常52例,治疗时间为2017年2月至2018年2月,将患者随机分为对照组和观察组,每组各26例患
目的:分析PTC指导下呼吸道感染抗生素治疗中的意义.方法:从医院2017年6月-2018年6月收治的下呼吸道感染患者中随机性的抽取80例作为本次临床观察的实验对象,对80例下呼吸道感