随着经济发展和世界人口的激增,全球能源和粮食消耗急剧增加。资源缺乏,生态环境恶化,耕地面积不断减少种种问题也随之而来。微藻的养殖受地域和季节影响较小,且不占用耕地。微藻资源的开发和利用顺应着社会的发展需要。富油新绿藻(Neochloris oleoabundans)具有高产油能力,有作为食品新资源生产食用油的潜力,但有关这种产油微藻的生物学特性在分子水平上的研究还十分不足。研究微藻叶绿体基因组有助于分类学研究、基因工程应用以及微藻资源在食品领域的开发和利用。本文首次对富油新绿藻的叶绿体分离条件进行优化,提取出其叶绿体基因组并进行测序,将获得的基因组序列与几种产油微绿藻的叶绿体基因组进行生物信息学分析和比较。本文的研究对于加深富油新绿藻分类学等生物学基础的认识、产油微藻在食用油基因工程研究以及生物活性物质在微藻叶绿体中高效表达提供研究基础。本文的主要研究内容及结果如下:(1)通过优化percoll密度梯度离心法对富油新绿藻叶绿体进行分离,确定了percoll密度组合为10%、35%、50%,结合恰当的离心机操作可以达到最好的分离效果。(2)通过对富油新绿藻的叶绿体基因组测序、序列组装、基因注释等一系列分析,得出富油新绿藻叶绿体基因组全长129716bp,45条基因得到注释。对简单重复序列(SSR)进行分析,发现共242个SSR,其中单核苷酸组成的SSR有222个,91.7%的SSR是A/T单碱基重复。(3)通过对两种产油微藻的叶绿体基因组密码子偏好性进行分析,结果表明,自然选择是影响两种产油微藻叶绿体基因密码子偏好性的主要因素,并确定了富油新绿藻叶绿体基因的最优密码子为TTA、ATT、GTA、TCT、CCA、ACT、GCA、AAA、GAA、TGT、CGT、GGT;索氏小球藻的最优密码子为TTT、TTA、ATT、GTT、TCA、CCA、ACA、GCT、TAT、TGA、CAT、CAA、AAT、AAA、GAT、GAA、CGT、GGT。(4)系统发育树结果表明,富油新绿藻在进化关系上与Ettlia属最为接近,与Neochloris aquatica的亲缘关系较差。